Search academic texts

Information × Registration Number 0417U003178, Candidate dissertation Status к.б.н. Date 30-05-2017 popup.evolution o Title Computational modeling of molecular dynamics simulations of H. sapiens tyrosyl-tRNA synthetase and its mutant forms Author Savytskyi Oleksandr Vyacheslavovych, popup.head Kornelyuk Oleksandr Ivanovych popup.opponent Сиволоб Андрій Володимирович popup.opponent Карпов Павло Андрійович Description Дисертацію присвячено дослідженню молекулярної динаміки H. sapiens тирозил-тРНК синтетази (HsTyrRS) та її мутантних форм у водно-іонному оточенні з використанням грід-технологій. Вперше побудована модель структури повнорозмірної HsTyrRS, для якої показано формування асиметричної компактної структури HsTyrRS, в якій цитокіновий ELR-мотив є екранованим в результаті взаємодії з С-модулем. Проведено комп'ютерне моделювання молекулярної динаміки мутантних форм тирозил-тРНК синтетази, пов'язаних з нейропатією Шарко-Марі-Туса, виявлено локальні конформаційні зміни в неструктурованій петлі CP1-вставки згортки Росcмана, які супроводжуються формуванням метастабільних b-структурних елементів. На основі побудованої моделі комплексу HsTyrRS з тРНК(Tyr) та фактором елонгації eEF1A2 запропоновано механізм впливу мутацій Шарко-Марі-Туса на взаємодію з її макромолекулами-партнерами. Висловлено припущення, що виявлені конформаційні ефекти можуть призводити як до зміни конформації активного центру, так і до зміни специфічних взаємодій мутантних форм з фактором елонгації eEF1A або/та тРНК(Tyr). Registration Date 2017-05-30 popup.nrat_date 2020-04-03 Close