Search academic texts

Registration Number

0420U101794, Candidate dissertation

Title

Aerobic spore-forming bacteria of deep-water sediments of the Black Sea

Author

Shtenikov Mykola D.,

popup.head Ivanitsya Volodymyr O.
popup.opponent Charchota Maxim A.
popup.opponent Vinnikov Albert I.
popup.opponent Romanovska Irina I.

Status

Кандидат біологічних наук, 03.00.07, Мікробіологія

Date

16-10-2020

Description

Дисертаційну роботу присвячено вивченню біологічної різноманітності та біологічних характеристик аеробних споротвірних бактерій глибоководних донних відкладень Чорного моря та визначенню їх потенціалу щодо продукції антимікробних сполук. В результаті досліджень в глибоководних осадах Чорного моря з екстремальними анаеробними умовами відкрито аеробні споротвірні бактерії, охарактеризовано їх біологічну різноманітність, а також біологічні властивості, структуру геномів, метаболомів та спектри антимікробних сполук антагоністично активних штамів. Вперше з донних відкладень Чорного моря виділено ізоляти споротвірних бактерій, які методом аналізу профілів жирних кислот віднесено до 14 видів та охарактеризовані за антагоністичною активністю по відношенню до опортуністичних патогенів людини і тварин. За результатами скрінингу відібрано 3 штами, ідентифіковані методами молекулярної філогенетики та порівняльної геноміки як B. velezensis ONU 553, B. pumilus ONU 554 та B. subtilis ONU 559, з найбільш високим рівнем антагоністичної активності. З використанням біоінформатичних інструментів вперше ідентифіковано біосинтетичні кластери ліпопептидів групи сурфактинів підгрупи пумілацидинів та гагеотетрину з групи сурфактинів, амікумацинового антибіотику АІ-77 та зроблено припущення про виявлення біосинтетичного кластеру пентапептиду GPFPI. Дані про інші сполуки, ідентифіковані для бацил вперше, потребують подальшої веріфікації. Отримані дані поповнюють знання про біосинтетичний потенціал морських бацил. Серед вторинних метаболітів досліджуваних штамів виявлено варіанти найбільш вивченого класу нерибосомних пептидів – сурфактинів (антеізо-C16-сурфактин, сурфактин B2 1-Me естер), гагеостатинів, фенгіцинів та амікумацинів, а також секретований пентапептид зі здатністю до інгібування протеаз GPFPI. Дані про інші сполуки, ідентифіковані для бацил вперше, потребують подальшої верифікації. Практичне значення отриманих результатів роботи полягає у поповненні Колекції морських бактерій Одеського національного університету імені І. І. Мечникова новими штамами, а отримані дані щодо геномів та екзометаболомів досліджених штамів можуть слугувати науковою основою для розробки на їх основі продуцентів нових для промисловості сполук та пробіотичних препаратів.