Search academic texts

Information × Registration Number 0405U004013, Candidate dissertation Status к.б.н. Date 25-10-2005 popup.evolution o Title Effect of Distal Mutations on Conformational Behavior of HIV-1 Protease: Molecular Dynamics Simulations Study. Author Kovalskyy Dmytro Borisovych, popup.head Kornelyuk Alexander Ivanovich popup.opponent Говорун дмитро Миколайович popup.opponent Кібірєв Володимир Костянтинович Description Вперше, методом молекулярної динаміки (МД) проведено систематичне вивчення конформаційної рухливості нативної ВІЛ-1 протеази за різних умов середовища та вивчення впливу дистальних мутацій L10I, L90M, A71V/G73S/I93L та E35Q/M36I/S37D/R57K на її конформаційну рухливість як, мехназім резистентності до інгібіторів. Показано, що конформаційна стабільність димеру протеази суттєво залежить від протонованого стану каталітичної діади Asp25/25'. Вперше встановлено два механізми впливу дистальниих мутацій на конформаційні коливання ВІЛ-1 протеази - через перерозподіл узгоджених рухів та через зміну доступних конформаційних рухів. Розроблено алгоритми порівняння даних методів ЯМР да МД. Розроблено алгоритми порівняння динамічних характеристик двох білків з даних розрахунку МД. Розроблено універсальну схему вивчення впливу дистальних мутацій на конформаційну поведінку білків. Отримані дані можуть бути використані для розробки інгібіторів ВІЛ-1 протеази нового покоління, активних як проти нативної протеази так і її певних резистентних типів. Registration Date 2005-10-25 popup.nrat_date 2020-04-04 Close