Registration Number
0417U000070, Candidate dissertation
Status
к.б.н.
Date
27-12-2016
popup.evolution
.
Title
Structural and functional basis of the editing activity of prolil-tRNA synthetase from Enterococcus faecalis
Author
Boyarshin Kostiantyn Sergiyovych,
popup.head Yaremchuk Hanna Dmytrivna
popup.opponent Сиволоб Андрій Володимирович
popup.opponent Верьовка Сергій Вікторович
popup.rada
Institute of molecular biology & genetics
Description
Дисертація присвячена механізмам редагування проліл-тРНК синтетазою прокаріотичного типу продуктів помилкового впізнавання аланіну - аланіл-аденілата і аланіл-тРНКПро. Вперше показано тРНК-залежність швидкості гідролізу аланіл-аденилата ПроРС, що зветься претрансферним редагуванням. Встановлено необхідність 2'- і 3'-гідроксильних груп А76 тРНКПро для прискорення гідролізу аланіл-аденілата. Визначено амінокислотні залишки, що забезпечують ефективність гідролізу аланіл-тРНКПро, що зветься посттрансферним редагуванням. Визначено ключову роль 2'-гідроксильної групи А76 аланіл-тРНКПро в її деацилюванні. Співставлення отриманих експериментальних даних з результатами комп'ютерного моделювання дозволило підтвердити квантово-механічну модель субстрат-асистованого каталітичного гідролізу аланіл-тРНКПро. Співставлення каталітичного механізму гідролізу аланіл-тРНКПро ПроРС бактеріального типу з іншими запропонованими механізмами ферментативного каталізу деацилювання аміноацил-тРНК дозволило підкреслити його оригінальність і функціональну важливість внутрішньомолекулярних взаємодій у субстраті.
Registration Date
2017-01-13
popup.nrat_date
2020-04-03 / 2026-06-29
