Search academic texts

Information × Registration Number 0420U100818, Candidate dissertation Status Кандидат біологічних наук Date 01-07-2020 popup.evolution o Title Structural and functional organization of the genomes of temperate phages 49 and 59 Erwinia horticola Author Zlatohurska Maryna , popup.head Tovkach Fedir I. popup.opponent Rud Yurii P. popup.opponent Budzanivska Iryna Hennadiivna popup.review Polischuk Lyudmyla popup.review Maksymenko Liudmyla Oleksandrivna Description Дисертаційна робота присвячена вивченню структурної та функціональної організації геномів помірних ервініофагів 49 і 59, а також фаг-фагової та фаг-бактеріальної взаємодії в системі фітопатогенного хазяїна Erwinia horticola ‒ збудника чорного бактеріозу бука лісового (Fagus sylvatica) в Україні. Здійснено порівняльний геномний аналіз помірних фагів 49 і 59 E. horticola, які є унікальними, оскільки не виявляють подібності до геномів раніше секвенованих вірусів Enterobacteriaceae. Між собою досліджувані фаги мають 47% ідентичності, що відноситься до генів пакування ДНК, структурної організації капсиду та касети лізису. На основі виявленої синтенії генів та структури модулю лізогенії ервініофаги 49 і 59 віднесено до лямбдоїдної групи фагів. У зв’язку з наявністю даних секвенування, відомості щодо організації віріонних ДНК фагів 49 і 59 були уточнені та доповнені. Для цього порівнювали дані експериментального рестрикційного аналізу з результатами рестрикції in silico. Характер рестрикційних патернів свідчить про безперервну циклічну пермутацію ДНК фага 59 та дискретний характер пермутації ДНК фага 49. Віріонна ДНК фага 59 містить KpnI-сайти, недоступні для дії рестриктази. Визначено, що для фага 59 притаманна гетерогенність популяції при розмноженні на мутантному ауксотрофному штамі E. horticola 450 His3. Вона полягає в наявності двох варіантів часток з різним розміром капсида. Такі віріони упаковують ДНК однакового розміру і складаються з однакових структурних поліпептидів, однак окремі мажорні структурні білки відрізняються кількісним вмістом. Встановлено, що взаємодія фага 49 з резидентним профаговим елементом культури E. horticola 450(59) характеризується розвитком абортивної відповіді, що полягає в зниженні ефективності висіву та зменшенні виходу життєздатного фагового потомства внаслідок порушення морфогенезу. Показано, що продукція двох помірних фагів 49 і 59 відбувається в результаті взаємодії клітин E. horticola 450 і 60 з каротоворіцинами типу фагових хвостових відростків Pectobacterium carotovorum, а також фагами Т2 і Т4 Escherichia coli. Інтерпретуючи дані літератури та результати власних досліджень, була запропонована гіпотетична модель нового явища фаг-фагової індукції. Переглянуто джерело походження фагів 49 і 59, які мають розглядатися як фаги E. horticola, а не P. carotovorum. Registration Date 2020-07-01 popup.nrat_date 2020-08-10 Close