Пошук академічних текстів

Інформація × Реєстраційний номер 0420U100818, Кандидатська дисертація На здобуття Кандидат біологічних наук Дата захисту 01-07-2020 Статус Запланована Назва роботи Структурна і функціональна організація геномів помірних фагів 49 і 59 Erwinia horticola Здобувач Златогурська Марина Анатоліївна, Керівник Товкач Федір Іванович Опонент Рудь Юрій Петрович Опонент Будзанівська Ірина Геннадіївна Рецензент Поліщук Людмила Василівна Рецензент Максименко Людмила Олександрівна Опис Дисертаційна робота присвячена вивченню структурної та функціональної організації геномів помірних ервініофагів 49 і 59, а також фаг-фагової та фаг-бактеріальної взаємодії в системі фітопатогенного хазяїна Erwinia horticola ‒ збудника чорного бактеріозу бука лісового (Fagus sylvatica) в Україні. Здійснено порівняльний геномний аналіз помірних фагів 49 і 59 E. horticola, які є унікальними, оскільки не виявляють подібності до геномів раніше секвенованих вірусів Enterobacteriaceae. Між собою досліджувані фаги мають 47% ідентичності, що відноситься до генів пакування ДНК, структурної організації капсиду та касети лізису. На основі виявленої синтенії генів та структури модулю лізогенії ервініофаги 49 і 59 віднесено до лямбдоїдної групи фагів. У зв’язку з наявністю даних секвенування, відомості щодо організації віріонних ДНК фагів 49 і 59 були уточнені та доповнені. Для цього порівнювали дані експериментального рестрикційного аналізу з результатами рестрикції in silico. Характер рестрикційних патернів свідчить про безперервну циклічну пермутацію ДНК фага 59 та дискретний характер пермутації ДНК фага 49. Віріонна ДНК фага 59 містить KpnI-сайти, недоступні для дії рестриктази. Визначено, що для фага 59 притаманна гетерогенність популяції при розмноженні на мутантному ауксотрофному штамі E. horticola 450 His3. Вона полягає в наявності двох варіантів часток з різним розміром капсида. Такі віріони упаковують ДНК однакового розміру і складаються з однакових структурних поліпептидів, однак окремі мажорні структурні білки відрізняються кількісним вмістом. Встановлено, що взаємодія фага 49 з резидентним профаговим елементом культури E. horticola 450(59) характеризується розвитком абортивної відповіді, що полягає в зниженні ефективності висіву та зменшенні виходу життєздатного фагового потомства внаслідок порушення морфогенезу. Показано, що продукція двох помірних фагів 49 і 59 відбувається в результаті взаємодії клітин E. horticola 450 і 60 з каротоворіцинами типу фагових хвостових відростків Pectobacterium carotovorum, а також фагами Т2 і Т4 Escherichia coli. Інтерпретуючи дані літератури та результати власних досліджень, була запропонована гіпотетична модель нового явища фаг-фагової індукції. Переглянуто джерело походження фагів 49 і 59, які мають розглядатися як фаги E. horticola, а не P. carotovorum. Дата реєстрації 2020-07-01 Додано в НРАТ 2020-08-10 Закрити