Registration Number
0825U002370, PhD dissertation
Status
Доктор філософії
Date
21-08-2025
popup.evolution
.
Title
Microbiological justification of personalized intestinal microbiome correction in individuals with irritable bowel syndrome
Author
Svitlana A. Burmei,
popup.head Nadiya V. Boyko
popup.opponent Hanna V. Yamborko
popup.opponent Andriy O. Mikheev
popup.opponent Svitlana G. Danylenko
popup.review Mariya A. Derbak
popup.rada
Uzhhorod National University State Higher Educational Institution
Description
У роботі представлено мікробіологічне обґрунтування створення персоналізованого біопрепарату (фармабіотику) для корекції кишкового мікробіому в осіб із синдромом подразненого кишечнику (СПК). З огляду на актуальність проблеми та зростаючу поширеність функціональних порушень шлунково-кишкового тракту, зокрема СПК, дослідження було спрямоване на поєднання класичних мікробіологічних та сучасних омікс-підходів (насамперед NGS – секвенування нового покоління) для ідентифікації мікробіомних порушень та вибору оптимальних пробіотичних штамів для модуляції мікробного складу кишечника.
Вперше було проведено комплексну оцінку мікробіому учасників із різними підтипами СПК (з діареєю, закрепом, змішаним типом), визначено найбільш характерні біомаркери та патерни дисбіозу, включно з порушенням співвідношення Firmicutes/Bacteroidetes, підвищеним рівнем Prevotella copri, зниженням Faecalibacterium prausnitzii та Akkermansia muciniphila. Застосовано високоточне метагеномне секвенування 16S рРНК гена, що дозволило визначити таксономічний склад мікробіоти з високою роздільною здатністю. Результати оброблялися за допомогою програмного пакету QIIME 2 та бази даних Silva 138, що забезпечило надійність біоінформатичного аналізу.
Було виділено та ідентифіковано понад 1900 мікробних штамів. Проведено мікробіологічний посів та визначення антибіотикочутливості ізолятів. Виявлено, що СПК різних типів супроводжується різними спектрами умовно-патогенної біоти та полірезистентністю до антибіотиків, що підкреслює доцільність пробіотичної модуляції замість емпіричного антибіотиколікування.
У межах дослідження було протестовано шість пробіотичних штамів (Lactiplantibacillus plantarum A, Lactobacillus bulgaricus A6, A22, S6, S19, Lacticaseibacillus rhamnosus S25), відібраних за морфофункціональними характеристиками та ефективністю модуляції кишкової мікробіоти. Проведено дослідження біосумісності та антагоністичної дії щодо характерних для СПК ізолятів. Встановлено, що комбінації штамів L. bulgaricus S6 + L. rhamnosus S25 є ефективними при СПК із закрепами, штами L. bulgaricus A6 + S6 — при діареї, а L. bulgaricus A22 + S25 — при змішаному типі СПК.
Особливу увагу приділено технологічним аспектам створення фармабіотику: оптимізації складу середовищ для культивування, умов кріозбереження, вибору кріопротекторів, а також тестуванню стабільності штамів після ліофілізації. Використання електронного прискорювача для активації водних розчинів пробіотиків стало інноваційним елементом проєкту, що потребує подальших експериментальних підтверджень.
Таким чином, у роботі запропоновано науково обґрунтований підхід до створення персоніфікованих фармабіотиків для цілеспрямованої корекції мікробіому при СПК. Отримані результати можуть бути використані як основа для подальших розробок у галузі мікробіомної терапії та біотехнології пробіотичних препаратів.
КЛЮЧОВІ СЛОВА: синдром подразненого кишечника, кишковий мікробіом, секвенування нового покоління (NGS), пробіотики, фармабіотики, персоніфікована корекція, технологічні аспекти, біосумісність, антибактеріальна активність, ліофілізація.
Registration Date
2025-06-17
popup.nrat_date
2025-06-17 / 2026-07-01
