Registration Number
0419U003007, Candidate dissertation
Status
Кандидат ветеринарних наук
Date
12-06-2019
popup.evolution
.
Title
Indication and species differentiation of causative agent of Chlamydiosis in animals by polymerase chain reaction
Author
Korniienko Maryna V.,
popup.head Zavgorodnii Andrii І.
popup.opponent Sytiuk Mykola P.
popup.opponent Nalyvaiko Liudmyla I.
popup.rada
National Scientific Center Institute of Experimental and Clinical Medicine
Description
Дисертація присвячена розробленню ПЛР-методик для ідентифікації та видової диференціації бактерій роду Chlamydia. Для цього проведено біоінформатичні дослідження шляхом вирівнювання первинних нуклеотидних послідовностей генів, що кодують 16S rRNA, RNase P RNA та МОМР. Вивчено рівень гомології та варіабельності нуклеотидних послідовностей ДНК трьох означених генів. Проведено порівняльний, філогенетичний, згрупований та загальний аналіз генів. Сконструйовано, для кожного з 10 видів хламідій, дизайн олігонуклеотидних праймерів на специфічні ділянки гена, що кодує МОМР. Дослідно-практичним шляхом відпрацьовано співвідношення реакційної суміші та режиму ампліфікації праймерних систем до отримання чітких смуг заданого розміру на електрофореграмах зразків контрольних ДНК бактерій роду Chlamydia. Розроблені нами 10 ПЛР-методик індикації та видової диференціації хламідій пройшли випробування на аналітичну специфічність і чутливість, а також валідацію з методиками, що лежить в основі 7 інших ПЛР тест-систем для діагностики хламідійних інфекцій. При цьому досліджено 35 зразків біологічного матеріалу, а саме: 11 зразків контрольних ДНК, 18 зразків ДНК хламідій, виділених з біологічного матеріалу від свійських тварин, 3 зразки ДНК від лептоспір і 3 зразки ДНК від бабезій. Розроблено два алгоритми застосування діагностичних ПЛР-методик. Проведено епізоотологічний скринінг хламідіозної інфекції у господарствах різних районів Полтавської області та встановлено видову циркуляцію хламідій серед ВРХ та свиней. Таким чином, проведені дослідження дали змогу сконструювати досить чутливі, аналітично-специфічні методики ідентифікації кожного з 10 видів бактерій роду Chlamydia у ПЛР.
Registration Date
2019-06-19
popup.nrat_date
2020-04-03 / 2026-06-29
