Registration Number
0225U004063,
(0117U000204)
, R & D reports
Title
New approaches to target-directed search for the potential antitumor and anti-infective agents to overcome the problem of drug resistance
popup.stage_title
Визначення особливостей взаємодії інгібіторів АРСаз із ензимами з використанням докінгу, молекулярної динаміки та метадинаміки. Біохімічне тестування інгібіторів АРСаз, ТопоІ та FGFR1 in vitro, структурна оптимізація інгібіторів на основі моделей зв'язування, критеріїв подібності до лікарських засобів та даних біологічного тестування. Дослідження антипроліферативної дії активних інгібіторів FGFR1 на пухлинних клітинних лініях. Оцінка цитотоксичності інгібіторів ТопоІ та FGFR1. Дослідження структури області, що містить 3'-сайт сплайсингу А7 і елементи, що регулюють його функціонування, в геномних РНК ВІЛ-1 різних груп і підтипів і геномних РНК вірусу ВІМ та створення відповідних розділів бази даних. Узагальнення результатів досліджень.
Head
Dubey Igor Ya., Доктор хімічних наук
Registration Date
03-11-2025
Organization
Institute of Molecular Biology and Genetics of NAS of Ukraine
popup.description1
popup.description2
Using pharmacophore screening, new multitarget inhibitors of LeuRS and MetRS of M. tuberculosis were found. Their antibacterial activity against the pathogenic strain of M. tuberculosis H37Rv was studied. The most active compound has a MIC (minimum inhibitory concentration) value in the range of 0.78-2.3 uM, depending on the cultural medium and is non-toxic against human cell lines HEK293 and HepG2 (IC50 > 100 uM), which indicates a selective effect against M. tuberculosis. Antitumor activity of a number of FGFR1 inhibitors on the Jurkat T-lymphoblastic leukemia cell line and cytotoxicity on the normal HEK293 cell line were studied. 2 compounds showed antiproliferative activity with EC50 of 125 and 215 uM and did not affect the survival of normal cells. A new efficient inhibitor of topoisomerase I of the cyanine class with IC50 of 100 nM was obtained. The structure of the Dickerson dodecamer as a model of duplex DNA was optimized by the DFT quantum-chemical method, and the optimal conformations of the ligands were calculated. The energy parameters of complexes of model DNA of the intercalative and non-intercalative type with topoisomerase I inhibitors of various classes were obtained. The primary and secondary structure of the region of the HIV-1 genome containing the 3'-splice site A7 and the elements regulating its functioning were studied for several hundred HIV-1 genomes of various groups and subtypes, and genomic RNA of the simian immunodeficiency virus SIV. A new model of secondary structure of this domain of HIV-1 (length 169 nucleotides) was proposed. A corresponding section of CESSHIV-1 database of control elements of the viral genome was created.
Product Description
popup.authors
Chernii Svitlana V.
Yaremchuk Hanna D.
Anatolii R. Syniuhin
Prykhod'ko Andriy Oleksandrovych
Serhii M. Yarmoliuk
Shyryna Tetyana V
Mykola M. Ilchenko
Oleksii V. Borovikov
Platonov Maxim O.
Palchykovska Larisa Gnativna
Balanda Anatoliy Olexiyovych
Andrii L. Potiahailo
Dmytro V. Kryvorotenko
Serhii А. Starosyla
Ihor M. Kotei
Volodymyr H. Bdzhola
Valentyna H. Kostina
Mykhailo A. Tukalo
Halyna P. Volynets
Horb Leonid H.
Stepaniuhin Andrii V.
Hudzera Olha Y.
Kryklyvyi Ivan A.
Protopopov Mykola V.
Kolomiiets Iryna M.
Marharyta I. Zarudna
Lukashov Serhii S.
Ihor Y. Dubei
Oksana P. Kovalenko
Inna V. Aleksieieva
Valentyna V. Nehrutska
Serhii S. Tarnavskyi
popup.nrat_date
2025-11-03
