Пошук академічних текстів

Інформація × Реєстраційний номер 0213U002368, 0112U004219 , Науково-дослідна робота Назва роботи Розробка енсембль-методу з високим ступенем паралелізації для моделювання мереж генної регуляції у Грід-середовищі Назва етапу роботи Керівник роботи Оболенська Марія Юріївна, Дата реєстрації 25-01-2013 Організація виконавець Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Опис етапу В ВО sysbio з використанням ПЗ Banjo, Aracne, PCIT, MRNET методами на основі динмамічних баєсових мереж (алгоритм відпалу, жадібні алгоритмі) та інформаційної теорії (спільна інформація, Гаусове ядро) проведено реконструкцію генної мережі E.Coli та синтетичних мереж-золотих стандартів. Проведено аналіз точності реконструкції кожного з методів (у порівнянні з золотими стандартами). Опис продукції Адаптоване ПЗ Aracne, Banjo для роботи у грід-середовищі; створений відкритий репозиторій коду/бібліотек + wiki для роботи із мережами генної регуляції у ГРІД-середовищі; набір скриптів для автоматичної подачі задач на грід та для роботи з даними генної експресії; генерація набору синтетичних мереж для перевірки точності методів реконструкції; створений енсембль методу реконструкції генних мереж Автори роботи Куклін Андрій Володимирович Оболенська Марія Юріївна Токовенко Богдан Тарасович Фролова Аліна Олекандрівна Фролова Аліна Олекандрівна Додано в НРАТ 2020-04-02 Закрити