Пошук академічних текстів

Інформація × Реєстраційний номер 0219U102013, 0119U103067 , Науково-дослідна робота Назва роботи Нові низькомолекулярні біорегулятори як ефективні агенти проти мультирезистентних клінічних ізолятів Acinetobacter baumannii у дослідженнях in silico та in vitro. Назва етапу роботи Керівник роботи Метелиця Лариса Олексіївна, Дата реєстрації 13-12-2019 Організація виконавець Інститут біоорганічної хімії та нафтохімії ім. В.П. Кухаря Національної академії наук України Опис етапу За допомогою пошукових Інтернет-ресурсів ChEMBL та PubChem було відібрано та проаналізовано більш як 200 наукових робіт та створено вибірки сполук для подальшого аналізу даних щодо відомих інгібіторів чутливих та резистентних штамів бактерії A. baumannii. Для кожної вибірки даних створено загальну таблицю, що містить інформацію про склад та джерело інформації. Порядок підготовки даних та внесення в базу OCHEM виконано за стандартною процедурою. Для введення даних в базу QCHEM на перщому етапі за допомогою вікна браузера було створено нову властивість під іменем “AcinBaum_MIC”. Початкова інформація про активність сполук вводились в нМ або мг/мл та конвертувались в логарифмічні значення одиниць вимірювання. Детальний аналіз літературних джерел дозволив зформувати базу даних хімічних сполук, що налічує більш як 3 тисячі молекул із різним потенціалом активності проти Acinetobacter baumannii. Дані є доступними на сайті OCHEM та є основою для подальшої розробки QSAR моделей. Опис продукції За результатами аналізу більше 200 статей, обраних за базами молекулярних структур ChEMBL та PubChem ідентифіковано майже 3000 сполук, активних проти мікробного патогену A. baumannii. На основі отриманої інформації створено широку базу опублікованих експериментальних про їх антибактеріальну активність щодо Acinetobacter baumannii. Всі відібрані сполуки наразі збережені на сервері OCHEM за такими стандартними характеристиками, як ідентифікація сполуки, хімічна та структурна формули, сполука у форматі SMILES, антибактеріальна активність у значеннях MIC (мінімальна інгібуючи концентрація).. Таким чином, модуль бази OCHEM після автоматичної перевірки наявності дублікатів та одночасного редагування записів адекватно та якісно виконав пакетне завантаження даних у вигляді файлів Microsoft Excel або SDF із посиланням та можливістю відстежуванням оригінального джерела інформації для успішного подальшого використання. Автори роботи Година Діана Миколаївна Ковалішин Василь Володимирович Рогальський Сергій Петрович Семенюта Іван Володимирович Труш Марія Миколаївна Додано в НРАТ 2020-04-02 Закрити