Пошук академічних текстів

Інформація × Реєстраційний номер 0210U001056, 0107U001331 , Науково-дослідна робота Назва роботи Термодинаміка комплексоутворення ароматичних лигандів із ДНК Назва етапу роботи Керівник роботи Євстигнєєв Максим Павлович, Дата реєстрації 19-01-2010 Організація виконавець Севастопольський національний технічний університет Опис етапу Метою роботи є розробка методики обчислення внеску різних фізичних факторів у результуючу вільну енергію створення комплексів ароматичний Лиганд-ДНК. Для досягнення поставленої мети вирішуються наступні основні задачі: 1.З використанням методів одномірної 1H ЯМР спектроскопії й оптичної спектрофотометрії установлення залежностей спостережуваного експериментального параметру (хімічних зсувів або поглинання) від концентрації й температури в змішаному розчині Лиганд-ДНК; 2.Розрахунок результуючої зміни вільної енергії Гіббса (dG), ентальпії (dH), ентропії (dS) і теплоємності (dCp) у реакції комплексоутворення на основі експериментальних концентраційних і температурних залежностей; 3.Розрахунок просторових структур інтеркальованих комплексів Лиганд-ДНК на основі даних двомірної 1H ЯМР спектроскопії у водному розчині; 4.Розрахунок потенційних видів взаємодій при створенні комплексів Лиганд-ДНК на основі методів молекулярного моделювання; 5.Розрахунок внеску у вільну енергію комплексів Лиганд-ДНК від джерел, що мають ентропійну природу. Кінцевим результатом роботи є методика розрахунку внеску основних фізичних факторів у результуючу вільну енергію комплексів ароматичний Лиганд-ДНК: зміна конформаційної енергії ДНК і лиганда; зміна ступенів свободи при утворенні комплексу; гідрофобний внесок від розчинника; поліелектролітний внесок; а також внесок від атом-атомних взаємодій у комплексі та взаємодії із розчинником. Можливість кількісної оцінки внеску різних факторів у стабілізацію комплексів створює основу реалізації сучасної стратегії спрямованої модифікації структури ароматичного лиганда з метою оптимізації його медико-біологічного ефекту, а також поглиблення уявлень про зв'язування біологічно важливих ароматичних молекул з рецепторами в клітині: ДНК і білками. Опис продукції Методика розрахунку енергетичних внесків у реакцію комплексоутворення лігандів з ДНК враховує зміну конформаційної енергії ДНК і ліганду, внесок ван-дер-Ваальсових, електростатичних, гідрофобних взаємодій; поліелектролітний (іонний) внесок; внесок водневих зв'язків і внесок джерел сугубо ентропійної природи. "Ноу-хау" цієї методики полягає в тому, що незалежний теоретичний розрахунок багатьох енергетичних складових в сумі дає енергію Гіббса, яка співпадає з експериментом в розумних межах для сполук, які істотно розрізняються за структурою і властивостями. Автори роботи Євстигнєєв Максим Павлович Барановський Сергій Федорович Болотін Петр Андрійович Костюков Віктор Валентинович Додано в НРАТ 2020-04-02 Закрити