Реєстраційний номер
0211U006183,
0110U005175
, Науково-дослідна робота
Назва роботи
Застосування грід-ресурсу для біоінформаційного вивчення цитоскелету та високо пропускного віртуального скринінгу речовин з антимікротрубочковою активністю для потреб фармацевтики та захисту рослин
Назва етапу роботи
Керівник роботи
Блюм Ярослав Борисович,
Дата реєстрації
28-02-2011
Організація виконавець
Державне підприємство " Інститут харчової біотехнології та геноміки Національної академії наук України"
Опис етапу
Здійснено біоінформаційне дослідження первинних послідовностей альфа- і бета-тубулінів людини. На підставі даних PDB реконструйована просторова структура декількох білків рослинного цитоскелету: альфа-тубуліну Avena sativa, FtsZ-білку Arabidopsis thaliana та ін. Ідентифіковано 9 сайтів зв'язування сполук динітроанілінового ряду з молекулою цитозольної форми FtsZ-білку Arabidopsis thaliana. Визначено та проаналізовано 26 лігандів у комплексі з альфа-тубуліном із Avena sativa. Виконано верифікацію отриманих комплексів методами молекулярної динаміки із використанням обчислювань у Грід. Виконано методологічне дослідження ефективності молекулярного докінгу in silico із використанням CPU та GPU обчислювань.
Опис продукції
Методика високопропускного віртуального скринінгу речовин з антимікротрубочковую активністю із застосуванням грід-обчислювань
Автори роботи
Ємець А.І.
Демчук О.М.
Карпов П.А.
Пидюра М.О.
Раєвський О.В.
Самофалова Д.О.
Співак С.І.
Чехович О.Г.
Додано/оновлено в НРАТ
2020-04-02
