Реєстраційний номер
0214U005904,
0110U006119
, Науково-дослідна робота
Назва роботи
Створення прототипів тест-систем для ДНК-аналізу перебудов геному, що спричинюють моногенні спадкові патології та спадкову схильність до розвитку найбільш соціально важливих захворювань людини
Назва етапу роботи
Керівник роботи
Лівшиць Людмила Аврамівна,
Дата реєстрації
26-12-2014
Організація виконавець
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Опис етапу
Метою запропонованого проекту є розробка діагностичних методик аналізу алельних варіантів генів MTHFR, F5 та F2, що входять до панелі маркерів спадкової схильності до серцево-судинних захворювань, методом мультиплексної лігазної зонд-залежної ампліфікації. Для аналізу алельних варіантів даних поліморфних локусів розроблено дизайн специфічних LPO і RPO олігонуклеотидних зондів та праймерів з урахуванням відповідних температур плавлення LHS та RHS послідовностей, аналізу їх вторинної структури та ймовірністю таутомеризації між гуаніновими та тимідиновими залишками. Було підібрано склад та концентрації ключових компонентів реакційної суміші для лігазної та полімеразної ланцюгової реакцій - LPO та RPO зондів і праймерів, термостабільної ДНК-лігази та термостабільної ДНК-полімерази. Підібрано оптимальні температурно-часові режими для лігазної та полімеразної ланцюгової реакцій Розроблені методики апробовані на зразках ДНК з різними алельними варіантами досліджуваних поліморфізмів з використанням референсних зразків ДНК, аналіз яких проводився незалежно альтернативними методами. Дані діагностичні методики можуть бути використані для створення тест-систем ДНК-маркерів спадкової схильності до серцево-судинних захворювань.
Опис продукції
Розроблено діагностичні методики аналізу поліморфних варіантів генів MTHFR, F5, F2 з використанням мультиплексної лігазної реакції. Розроблено інформаційно- аналітичну документацію до розроблених прототипів тест систем. Розроблені методики апробовані на контрольних групах із загальної популяції України з використанням референсних зразків ДНК з відповідними поліморфними варіантами, аналіз яких проводився незалежно альтернативними методами.
Автори роботи
Грищенко Наталія Володимирівна
Кравченко Сергій Афанасійович
Кучеренко Анастасія Михайлівна
Лівшиць Ганна Борисівна
Нечипоренко Марина
Пампуха Володимир Миколайович
Чернушин Сергій Юрійович
Додано/оновлено в НРАТ
2020-04-02
