Реєстраційний номер
0214U006950,
0113U006029
, Науково-дослідна робота
Назва роботи
Розробка методологій мішень-направленого, раціонального пошуку нових протитуберкульозних препаратів
Назва етапу роботи
Керівник роботи
Тукало Михайло Арсентійович, Доктор біологічних наук
Дата реєстрації
15-04-2014
Організація виконавець
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Опис етапу
Розроблено генноінженерну конструкцію та створено штам-надпродуцент проліл-тРНК синтетази M. tuberculosis на базі штаму E. coli BL21(DE3)Star та запропоновано протокол отримання надпродуцента проліл-тРНК синтетази M. tuberculosis (ПроРСMt). Виділено і очищено ПроРСMt, оптимізовано умови її активності в реакції аміноацилювання тРНК та розроблено й оптимізовано регламент тестування інгібування активності проліл-тРНК синтетази M. tuberculosis в реакції аміноацилювання тРНК. Досліджено комплекси зв'язування 16 активних сполук із активним сайтом ЛейРСMt. Для найбільш перспективних лігандів встановлено залежності інгібувальної активності від їх хімічної структури (SAR). На основі п'яти найактивніших інгібіторів ЛейРСMt за допомогою веб-сервера ZINCPharmer розроблено три рецепторно-залежні фармакофорні моделі, які допоможуть прискорити подальші пошуки інгібіторів за рахунок звуження результатів докінгу та для оптимізації їхньої активності. Відібрано ліганди для подальшого біохімічного тестування їх інгібувальної активності мікобактеріальної проліл-тРНК синтетази (ПроРС). Для відбору лігандів було використано фармакофорну пост фільтрацію за наявністю ключових водневих зв'язків. Відбір проводили окремо для аденінзв'язувального та пролілзв'язувального підсайтів. Перевагу віддавали лігандам, які одночасно взаємодіють з обома підсайтами ПроРС M. tuberculosis. В результаті отримали сет із 209 лігандів, що буде використано для біохімічного тестування інгібувальної активності стосовно ПроРС M. tuberculosis на наступному етапі виконання проекту.
Опис продукції
Методика тестування інгібування активності проліл-тРНК синтетази M. tuberculosis в реакції аміноацилювання тРНК. Фармакофорна модель зв'язування інгібіторів з лейцил-тРНК синтетазою M. tuberculosis
Автори роботи
Бджола Володимир Григорович
Бояршин Костянтин Сергійович
Волинець Галина Петрівна
Грищенко Андрій Анатолійович
Гудзера Ольга Йосипівна
Кpикливий Iван Андрійович
Коваленко Оксана Петрівна
Лукашов Сергій Степанович
Остринська Ольга Василівна
Яpемчук Ганна Дмитрівна
Ярмолюк Сергій Миколайович
Додано/оновлено в НРАТ
2020-04-02
