Реєстраційний номер
0217U001537,
0116U006100
, Науково-дослідна робота
Назва роботи
Використання Грід та напрацювань віртуальної організації CSLabGrid для високопропускного скринінгу інгібіторів тубуліну паразитичних грибів
Назва етапу роботи
Керівник роботи
Блюм Ярослав Борисович,
Дата реєстрації
27-02-2017
Організація виконавець
Державна установа "Інститут харчової біотехнології та геноміки НАН України"
Опис етапу
За результатами високопропускного віртуального скринінгу більш ніж 7 млн речовин із використанням пакету UCSF Dock 6 (IFBG Cluster) було відібрано 200 перспективних речовин. На підставі аналізу оціночних функцій докінгу в CCDC Gold, а також візуальної оцінки побудованих комплексів, відібрано 30 найбільш перспективних сполук - потенційних інгібіторів тубулінів паразитичних грибів. Як найбільш перспективними для подальшого лабораторного дослідження in vitro, визначено 19 сполук синтезованих в Інституті органічної хімії НАН України.
Опис продукції
Скринінг проводився в два відомих сайти зв'язування для кожної із досліджуваних моделей тубулінів паразитичних грибів. Обрахунок молекулярного докінгу здійснювався за допомогою програми UCSF Dock 6 з одночасним використанням декількох обчислювальних серверів IFBG Cluster. База лігандів була підготовлена таким чином, щоб для всіх речовин були розраховані тривимірні структури та окремо були генеровані парціальні заряди AM1-bcc засобами програми Mopac7.
Автори роботи
Демчук О.М.
Карпов П.А.
Ожерєдов С.П.
Раєвський О.В.
Самофалова Д.О.
Співак С.І.
Додано/оновлено в НРАТ
2020-04-02
