Пошук академічних текстів

Інформація × Реєстраційний номер 0217U001537, 0116U006100 , Науково-дослідна робота Назва роботи Використання Грід та напрацювань віртуальної організації CSLabGrid для високопропускного скринінгу інгібіторів тубуліну паразитичних грибів Назва етапу роботи Керівник роботи Блюм Ярослав Борисович, Дата реєстрації 27-02-2017 Організація виконавець Державна установа "Інститут харчової біотехнології та геноміки НАН України" Опис етапу За результатами високопропускного віртуального скринінгу більш ніж 7 млн речовин із використанням пакету UCSF Dock 6 (IFBG Cluster) було відібрано 200 перспективних речовин. На підставі аналізу оціночних функцій докінгу в CCDC Gold, а також візуальної оцінки побудованих комплексів, відібрано 30 найбільш перспективних сполук - потенційних інгібіторів тубулінів паразитичних грибів. Як найбільш перспективними для подальшого лабораторного дослідження in vitro, визначено 19 сполук синтезованих в Інституті органічної хімії НАН України. Опис продукції Скринінг проводився в два відомих сайти зв'язування для кожної із досліджуваних моделей тубулінів паразитичних грибів. Обрахунок молекулярного докінгу здійснювався за допомогою програми UCSF Dock 6 з одночасним використанням декількох обчислювальних серверів IFBG Cluster. База лігандів була підготовлена таким чином, щоб для всіх речовин були розраховані тривимірні структури та окремо були генеровані парціальні заряди AM1-bcc засобами програми Mopac7. Автори роботи Демчук О.М. Карпов П.А. Ожерєдов С.П. Раєвський О.В. Самофалова Д.О. Співак С.І. Додано в НРАТ 2020-04-02 Закрити