Реєстраційний номер
0217U002843,
0116U004778
, Науково-дослідна робота
Назва роботи
Молекулярне типування та механізми еволюційної адаптації вірусів культурної і дикорослої флори України
Назва етапу роботи
Керівник роботи
Будзанівська Ірина Генадіївна,
Дата реєстрації
13-12-2017
Організація виконавець
Київський національний університет імені Тараса Шевченка
Опис етапу
Об'єкти дослідження: віруси культурних та дикорослих рослин, філогенетичні властивості, еволюція, механізми адаптації, епідеміологічні фактори, екологія вірусів. Мета роботи: філогенетичний аналіз та встановлення механізмів еволюційної адаптації вірусів рослин. Методи дослідження: вірусологічні, молекулярно-біологічні, філогенетичні та статистичні методи досліджень. Відібрані віруси, які становлять найбільшу небезпеку в карантинному та епідемічному аспектах. Проведено філогенетичний аналіз українських ізолятів М-вірусу картоплі, вірусу мозаїки сої, вірусу шарки сливи, вірусу мозаїки кавуну 2, вірусу жовтої мозаїки цукіні, встановлено їх спорідненість з іншими штамами цих вірусів. На основі отриманих молекулярно-генетичних даних визначені біологічно значущі механізми еволюційної адаптації цих вірусів. Зокрема, низькі показники dN/dS для ізолятів МВК свідчать про направлену дію негативного добору щодо гена СР як біологічно значущого механізму еволюційної адаптації українських ізолятів, вірогідним наслідком чого є підтримання генетичної стабільності популяцій вірусу. Аналогічно, підтверждено низький рівень варіабельності геному ВМК-2 в межах української популяції та високу консервативність популяцій ВЖМЦ. Розроблено і відпрацьовано діагностичні системи для вірусів зернових культур, що здатні до насіннєвої передачі: вірусу смугастої мозаїки пшениці та вірусу штрихуватої мозаїки ячменю.
Опис продукції
Відібрані віруси, які становлять найбільшу небезпеку в карантинному та епідемічному аспектах, проведено їх філогенетичний аналіз, встановлено ступінь спорідненості з іншими відомими ізолятами відповідних видів вірусів. На основі отриманих молекулярно-генетичних даних визначені біологічно значущі механізми еволюційної адаптації вірусів. Проаналізований зв'язок між стресовими факторами довкілля та тенденцією вірусів рослин до генетичних змін/підтримання консервативності геному.
Автори роботи
Бисов А.С.
Будзанівська І.Г.
Дуніч А.А.
Міщенко Л.Т.
Руднєва Т.О.
Снігур Г.О.
Шевченко О.В.
Шевченко Т.П.
Додано/оновлено в НРАТ
2020-04-02
