Пошук академічних текстів

Інформація × Реєстраційний номер 0218U002504, 0117U006668 , Науково-дослідна робота Назва роботи Створення розподіленої бази даних молекулярної динаміки та ЯМР у віртуальній лабораторії MolDynGrid Назва етапу роботи Керівник роботи Корнелюк Олександр Іванович, Дата реєстрації 29-03-2018 Організація виконавець Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Опис етапу Для ВЛ MolDynGrid на попередніх етапах виконання проекту вже було визначено ряд методів та впроваджені засоби для використання Cloud-технологій, що дозволили вирішити проблеми інсталяції програмного забезпечення на грід-ресурсах. Подальші цілі проекту - удосконалити існуючі та розробити нові методи для розширення множини можливих Cloud та грід-ресурсів, що використовуються для обрахунку задач ВЛ MolDynGrid На даний час в українському національному грід-сегменті за допомогою інтегрованого середовища віртуальної лабораторії MolDynGrid проводяться інтенсивні розрахунки молекулярної динаміки білків, які є мішенями для розробки нових лікарських препаратів. Відповідно до технічного завдання проведено та виконано наступні задачі. Оновлено розрахунковий блок, в якому додано функціональну можливість користування MolDynSub_CLI через веб-інтерфейс без облікового запису, а лише при наявності грід-сертификату та членства в ВО. Інтегровано утиліту MyProxyUpload для делегації прав WEB-Shell, що дозволяє тепер працювати на OS Windows. На кластері ІМБГ проведена інсталяція нами написаної програми S2 та адаптовано для роботи в грід. Також додано інтеграцію з базою даних траєкторій МД та спектрів ЯМР з аналітичним блоком. В результаті проведеної науково-дослідної роботи по розширенню можливостей обчислювального кластеру ІМБіГ НАНУ проведено встановлення грід-сервісів, що суттєво розширять можливості українських вчених для проведення аналітичних обчислень при дослідженнях молекулярної динаміки біологічних макромолекул на сучасному рівні та створять нові можливості не тільки продуктивно використовувати інфраструктуру УНГ, але й дозволять інтегрувати в міжнародні грід-середовища. Соответствии с техническим заданием проведения и выполнены следующие задачи. Опис продукції 1.Cтворення бази даних молекулярної динаміки та даних ЯМР-спектроскопії в рамках ВЛ MolDynGrid. 2. Розробка методів та програмних засобів для їх використання. 3. Вирішення задачі кореляції великих об'ємів даних розрахунків молекулярної динаміки з експериментальними даними по вивченню динаміки білків методом ЯМР-спектроскопії. Автори роботи Додано в НРАТ 2020-04-02 Закрити