Пошук академічних текстів

Інформація × Реєстраційний номер 0219U101204, 0115U005025 , Науково-дослідна робота Назва роботи Створення молекулярно-генетичних маркерів для диференціації різних генотипів рослин на основі вивчення поліморфізму інтронів генів їх цитоскелетних білків Назва етапу роботи Керівник роботи Пірко Ярослав Васильович, Дата реєстрації 29-05-2019 Організація виконавець Державна установа "Інститут харчової біотехнології та геноміки НАН України" Опис етапу  Встановлено, що екзонні ділянки генів білків цитоскелету є висококонсервативними , в той час як інтрони – гіперваріабельними, що є перспективним напрямком для розроблення ДНК-маркерів. На основі попереднього біоінформаційного пошуку та аналізу генів α- , β-тубуліну та актину закодованих в геномах A. thaliana, рису (O. sativa), льону-довгунця (L. иsitatissimum), картоплі (S. tuberosum) та томату (S. lycopersicum), були підібрані праймери для аналізу поліморфізму довжин інтронів в межах кожного виду. В цьому році проведений синтез видоспецифічних ПЛР праймерів для оцінки поліморфізму довжини інтронів генів ключових білків цитоскилету рослин, а саме α-, β-тубуліну та актину. Підібрані умови для ампліфікації І-го інтрону генів α-тубуліну A. thaliana, рису (O. sativa), льону-довгунця (L. иsitatissimum), картоплі (S. tuberosum) та томату (S. lycopersicum) з використанням відповідних видоспецифічних праймерів. У випадку генів β-тубуліну, для кожного модельного виду рослин синтезовано по дві пари праймерів, що дозволяють оцінити поліморфізм довжини як І-го так і ІІ-го інтронів. Підібрані оптимальні умови для ампліфікації інтронів генів β-тубуліну у A. thaliana, O. sativa, L. иsitatissimum, S. tuberosum та S. lycopersicum. Проведений синтез видоспецифічних праймерів для оцінки поліморфізму довжини інтронів генів актину у модельних видів вищих рослин. Підібрані оптимальні умови для ампліфікації інтронів генів актину у видів A. thaliana, O. sativa, L. иsitatissimum, S. tuberosum та S. lycopersicum. Проведений попередній ПЛР аналіз міжвидових та сортових вибірок модельних видів рослин з використанням ново розроблених видоспецефічних ДНК-маркерів. Опис продукції Синтезовані видоспецифічні вироджені праймери дають можливість оцінити поліморфізм довжини інтронів генів α-, β-тубуліну та актину різних видів вищих рослин. Данні праймери, як ДНК-маркери, потенційно придатні для генетичної диференціації популяцій (сортів) та видів вищих рослин, виявлення міжвидових гібридів, генотипування рослин тощо молекулярно-генетичного профілювання господарсько-цінних злакових видів тощо. За рахунок якісно підібраних умов ампліфікації інтронів генів α-, β-тубуліну та актину у A. thaliana, O. sativa, L. иsitatissimum, S. tuberosum та S. lycopersicum, показано утворення видоспецифічних ДНК профілів, які містили інтрони цільових генів. Проведений попередній аналіз поліморфізму довжин інтронів генів α-, β-тубуліну A. thaliana та сортових вибірок O. sativa, L. иsitatissimum, S. tuberosum та S. lycopersicum з використанням новорозроблених видоспецифічних ДНК-маркерів, результати якого будуть детально проаналізовані на подальших етапах. Автори роботи Блюм Ярослав Борисович Постовойтова Анастасія Сергіївна Рабоконь Анастасія Миколаївна Додано в НРАТ 2020-04-02 Закрити