Пошук академічних текстів

Інформація × Реєстраційний номер 0219U102043, 0119U102065 , Науково-дослідна робота Назва роботи Білки, що зв’язують саліцилову кислоту в рослинах: вивчення методами біохімії та молекулярної динаміки Назва етапу роботи Керівник роботи Кравець Володимир Степанович, Доктор біологічних наук Дата реєстрації 16-12-2019 Організація виконавець Інститут біоорганічної хімії та нафтохімії ім. В.П. Кухаря Національної академії наук України Опис етапу Рекомбінантний білок GAPDH A1, отриманий у чистому вигляді (>90%), було доочищено методом діалізу та сконцентровано за допомогою колонок Amicon Ultra Centrifugal Filter Unit. Аналогічним чином було підготовлено мутований білок GAPDH A1 R81L. Базуючись на даних комп’ютерного моделювання та молекулярних симуляцій GROMACS даний білок може характеризуватись зниженою здатністю до зв’язування саліцилової кислоти. Актуальний рівень зв’язування з саліциловою кислотою даних білків перевірявся методом поверхневого плазмонного резонансу. У якості ліганду використовувалась іммобілізована 3-аміноетил саліцилова кислота. Було показано, що нативний білок GAPDH A1 зв’язує іммобілізовану 3-аміноетил саліцилову кислоту з високою афінністю – константа дисоціації даної взаємодії становить Kd=28.3 нМ. Додатково проведено дослідження з конкурентного зв’язування іммобілізованої 3-аміноетил саліцилової кислоти у присутності надлишку вільної саліцилової кислоти. Показано, що присутність 2мМ вільної саліцилової кислоти призводить до практично повної втрати до взаємодії GAPDH A1 з іммобілізованим лігандом. Ці результати вказують на те, що дані сполуки конкурують за одне і теж саму місце зв’язування на поверхні білку. В свою чергу, рівень конкуренції за зв’язування з 4-гідроксибензойною кислотою (біологічно неактивний ізомер саліцилової кислоти) був суттєво нижчим. Ці дані вказують на біологічне значення взаємодії GAPDH A1-саліциловою кислотою. Опис продукції Дослідження проведено на високому методологічному рівні з використанням обладнання Інституту біології Париж-Сена. Отримані результати можуть стати основою для розробки природних нетоксичних засобів для боротьби зі шкідниками та інфекціями сільськогосподарських рослин. Зроблено дві спільні публікації з французькими партнерами – стаття (International Journal of molecular sciences, IF 4.18) та тези доповіді на конференції (ХІІ Український біохімічний конгрес). Автори роботи Покотило Ігор В'ячеславович Додано в НРАТ 2020-04-02 Закрити