Пошук академічних текстів

Інформація × Реєстраційний номер 0219U102149, 0119U102576 , Науково-дослідна робота Назва роботи Впровадження методу оцінки поліморфізму довжини інтронів генів гамма-тубуліну для молекулярно-генетичної диференціації рослин Назва етапу роботи Керівник роботи Рабоконь Анастасія Миколаївна, Дата реєстрації 20-12-2019 Організація виконавець Державна установа "Інститут харчової біотехнології та геноміки НАН України" Опис етапу  Під час виконання етапу проекту було проведено біонформаційний пошук генів γ-тубуліну у представників однодольних та дводольних рослин. За результатами цього аналізу встановлено, що γ-тубулін представлений у геномі рослин здебільшого 2 паралогічними генами, що містять 10-11 екзонів та 9-10 інтронів, відповідно. При цьому довжина інтронів генів γ-тубуліну варіює у різних ізотипів, тому метод оцінки поліморфізму довжини інтронів генів γ-тубуліну можливо використовувати для диференціації обраних рослин. До того ж, той факт, що в рослинному геномі знаходиться в середньому 2 гена γ-тубуліну значно спрощує подальший аналіз отриманих результатів. Для точнішого аналізу оцінки поліморфізму довжини інтронів генів γ-тубуліну у A. thaliana було здійснено дизайн видоспецифічних праймерів. За допомогою данного методу вперше було проаналізовано модельну рослину різушку Таля. Встановлено, що для A. thaliana найбільш ефективними є пара специфічних праймерів до другого інтрону другого ізотипу гена γ-тубуліну, адже дозволяє одночасно виокремити декілька зразків дикого типу та групу GFP-MAP4 зразків. Виявлено певний поліморфізм довжини інтронів досліджених зразків. Доведено, що запропонований метод може самостійно або в поєднані з іншими маркерами поліморфізму довжини інтронів різних генів використовуватися в молекулярно-генетичних дослідженнях льону, адже дає змогу ідентифіковувати та диференціювати сорти льону на основі отриманих ДНК профілів. Загалом встановлено, що метод оцінки поліморфізму довжини інронів генів γ-тубуліну з використанням вироджених праймерів ймовірно може бути вдало використаний для аналізу дводольних рослин. Опис продукції Проведена верифікація нового ДНК-маркеру для молекулярно-генетичного дослідження дводольних рослин. Біоінформативний аналіз досліджуваних рослин показав, що γ-тубулін в їх геномі представлений здебільшого 2 паралогічними генами. Вперше за допомогою цього ДНК-маркеру проаналізовано модельну рослину різушку Таля та виявлено, що для її вивчення найбільш ефективними є пара специфічних праймерів до другого інтрону другого ізотипу гена γ-тубуліну. Було показано можливість використання даного методу для диференціації сортів льону. Метод оцінки поліморфізму довжини інтронів генів γ-тубуліну проявив себе як швидкий, простий та надійний інструмент для молекулярно-генетичного аналізу представників дводольних рослин. Автори роботи Білоножко Юлія Олександрівна Постовойтова Анастасія Сергіївна Рабоконь Анастасія Миколаївна Додано в НРАТ 2020-04-02 Закрити