Пошук академічних текстів

Реєстраційний номер

0220U010165, 0118U006867 , Науково-дослідна робота

Назва роботи

Диференціація різних генотипів та сортів рослин шляхом оцінки поліморфізму довжини інтронів актину

Керівник роботи

Калафат Любов Олександрівна, Кандидат біологічних наук

Дата реєстрації

17-02-2020

Організація виконавець

Державна установа "Інститут харчової біотехнології та геноміки НАН України"

Опис

 Проведено біоінформатичний пошук генів актину в геномах Triticum aestivum, Hordeum vulgare та Brassica rapa. Встановлено, що екзонні ділянки генів актину у досліджених видів рослин є висококонсервативними, в той час як інтронні – гіперваріабельними, що може бути корисним для розроблення ДНК-маркерів, що базуються на оцінці поліморфізму інтронів. Проведено дизайн та синтез вироджених універсальних праймерів для оцінки поліморфізму довжини інтронів генів актину у вищих рослин. Тестування новорозробленої ДНК-маркерної системи, що виявляє поліморфізм довжини інтронів генів актину, проведено на вибірках однодольних та дводольних рослин різних таксономічних груп. ДНК-маркерна система, що оцінює поліморфізм довжини інтронів генів актину, дозволила якісно генотипувати та диференціювати популяції Ae. Biuncialis в Криму, виявивши значну кількість поліморфних ампліконів інтронів генів актину. Показано високу гетерогенність та генетичну неоднорідність досліджених природних популяцій егілопсу. Здійснено аналіз поліморфізму довжини інтронів генів актину у антарктичного виду Deschampsia аntarctica. Встановлено генетичний мономорфізм за даним видом ДНК-маркерів. Також проведено генотипування та диференціацію сортів ячміню (Hordeum vulgare L.), томату (S. lycopersicum), картоплі (S. tuberosum), а також сортів льону-довгунця української та білоруської селекції. Загалом отримано видоспецифічні ДНК-профілі з певним набором фрагментів інтронів генів актину для всіх проаналізованих видів рослин. В цілому ДНК-маркери, що оцінюють поліморфізм довжини інтронів генів актину, дозволили якісно генотипувати види та сорти рослин.

Опис продукції

ДНК-маркерна система, що оцінює поліморфізм довжини інтронів генів актину, дозволила якісно генотипувати та диференціювати популяції Ae. Biuncialis в Криму, популяції антарктичного виду Deschampsia аntarctica, сортив ячміню (Hordeum vulgare L.), томату (S. lycopersicum), картоплі (S. tuberosum), а також сорти льону-довгунця української та білоруської селекції. Отримано видоспецифічні ДНК-профілі з певним набором фрагментів інтронів генів актину для всіх проаналізованих видів рослин. В цілому ДНК-маркери, що оцінюють поліморфізм довжини інтронів генів актину, дозволили якісно генотипувати види та сорти рослин.

Автори роботи

Білоножко Юлія Олександрівна
Демкович Андрій Євгенович
Калафат Любов Олександрівна
Пірко Надія Миколаївна
Пірко Ярослав Васильович
Постовойтова Анастасія Сергіївна
Приваліхін Сергій Миколайович
Рабоконь Анастасія Миколаївна