Пошук академічних текстів

Інформація × Реєстраційний номер 0220U101255, 0117U000378 , Науково-дослідна робота Назва роботи Розробка геномних підходів для встановлення генетичного різноманіття рідкісних та ендемічних видів рослин і тварин. Назва етапу роботи Керівник роботи Кіш Роман Ярославович, Дата реєстрації 07-02-2020 Організація виконавець Державний вищий навчальний заклад "Ужгородський національний унiверситет" Опис етапу Реалізацією проекту закладено початок процесу документування геномного різноманіття в Україні. Здійснено збір зразків зі всіх відомих в Україні природних локалітетів M. transsilvanicum (з них три виявлені вперше), екстраговано ДНК у 16 особин (по дві з кожної популяції). Виконано пошук гнізд та вперше отримано унікальні зразки (пір’їн з за¬лишками крові) та екстраговану ДНК від 35 пташенят C. nigra з природних популяцій України та, з метою порівняння, чотирьох пташенят C. ciconia.  Опис продукції Вперше в Україні здійснений селективний підбір технологій для повногеномного секвенування (відібрано дві найбільш ефективні на сьогодні платформи секвенування наступного покоління Illumina HiSeq та BGISeq500) та з метою вивчення між- та внутрішньо-популяційної геномної мінливості розроблений оптимальний та ефективний пакет програмного забезпечення для аналізу, фільтрування та інтерпретації геномної інформації, збору геному конкретного виду. Здійснено повногеномне секвенування, збірку та анотацію двох геномів – C. ciconia (розмір генома 1.62 Гб) і M. transsilvanicum (розмір генома 4.95 Гб). Проаналізовано якість секвенування і визначено структурні елементи обидвох геномів, ідентифіковано та виключено фрагменти, що не мають функціонального значення. Отримана збірка є доступною для поповнення і уточнення інформації, яка буде вдосконалюватися шляхом залучення додаткових даних. Автори роботи Будніков Геннадій Борисович Волфсбергер Валтер Валтерович Олексик Тарас Хомич Додано в НРАТ 2020-04-02 Закрити