Пошук академічних текстів

Інформація × Реєстраційний номер 0220U101733, 0120U100055 , Науково-дослідна робота Назва роботи Різноманіття угруповань бактеріопланктону в районі архіпелагу Аргентиські острови: створення та апробація методологічного молекулярно-генетичного підходу Назва етапу роботи Керівник роботи Яненко Уляна Миколаївна, Кандидат біологічних наук Дата реєстрації 19-02-2020 Організація виконавець Державна наукова установа "Державний центр інноваційних біотехнологій" Опис етапу В рамках проекту нами було розроблено та випробувано протокол молекулярно-генетичного дослідження угруповань бактеріопланктону за специфічними генами. Перш за все, в рамках експерименту було визначено оптимальний протокол виділення ДНК. Це перший і дуже суттєвий етап молекулярно-генетичного дослідження, від успішності якого залежить перебіг всіх наступних кроків та адекватна інтерпретації даних. За сукупністю даних з якості та кількості отриманих нуклеінових кислот, ми висунули рекомендації з використання комерційного набору DNeasy Power Soil KIt (QIAGEN). Даний набір забезпечує швидкий та якісний результат і, що важливо не потребує додаткової реагентики, простору та специфічного обладнання. Отже обраний протокол екстракції може використовуватись у польових умовах, зокрема на УАС Академік Вернадський. Важливою частиною нашого дослідження був підбір праймерів та умов ампліфікації для специфічних до певних таксонів генів. Моніторинг потребує особливо ретельно розроблених та апробованих методик, які даватимуть відповідні та порівнювані результати в рамках довгострокових досліджень. Саме тому ми підібрали оптимальні умови ПЛР, приділивши особливу увагу температурі віджигу праймерів за наших експериментальних умов. Врезультаті, отримані нами оптимальні температури відрізнялись від тих, які було запропоновано в попередніх роботах, але вони забезпечили отримання результатів, які узгоджувалисьз іншими дослідженнями бактеріопланктону у регіогні. Враховуючи, узгодженість отриманих нами результатів та доступність методики ми рекомендуємо використання розробленого протоклу в рамках довгострокового морського моніторингу на УАС Академік Вернадський. Опис продукції Застосування методів молекулярного аналізу, запропонованих нами, дозволяє отримати максимально точні та валідні дані по розподілу домінантних таксономічних груп бактеріопланктону на різних стадіях цвітіння фітопланктону. Запропонована методика є сучасною та дозволяє отримати максимально повну картину біорізноманіття бактерій, на відміну від культиваційних методів. Дані отримані таким чином відповідають міжнародним стандартам і можуть бути використані у порівняльному аналізі, а, за умови тривалого застосування у монітрингу, можуть бути інкопоровані в моделі впливу змін клімату на морську ексосистему у досліджуваному регіоні. Дані по розподілу домінантних таксономічних груп бактеріопланктону рекомендовано використовувати при пріорітеризації та плануванні наступних сезонних робіт на антарктичній станції “Академік Вернадський”. Автори роботи Балабуха Людмила Віталіївна Давиденко Тетяна Іванівна Дяченко Ірина Іванівна Завірюха Ганна Анатоліївна Додано в НРАТ 2020-04-02 Закрити