Пошук академічних текстів

Інформація × Реєстраційний номер 0220U104577, 0120U103863 , Науково-дослідна робота Назва роботи Білки, що зв’язують саліцилову кислоту в рослинах: вивчення методами біохімії та молекулярної динаміки Назва етапу роботи Керівник роботи Кравець Володимир Степанович, Доктор біологічних наук Дата реєстрації 23-12-2020 Організація виконавець Інститут біоорганічної хімії та нафтохімії ім. В.П. Кухаря Національної академії наук України Опис етапу  Встановлено, що рекомбінантний білок гліцеральдегід 3-фосфатдегідрогеназа GAPA1 з Arabidopsis thaliana зв'язує функціональний аналог саліцилової кислоти – 3-аміноеилсаліцилову кислоту (3-АЕСК). Одночасно було показано, що нативна саліцилова кислота (СК) конкурує за зв’язування з гліцеральдегід 3-фосфатдегідрогеназою GAPA1 в присутності 3-АЕСК. Отримані дані вказують на те, що 3-АЕСК та СК конкурують за одні і ті ж сайти зв’язування на поверхні білку. Ідентифікація даних сайтів була проведена методами молекулярної динаміки (GROMACS) з подальшою верифікацією результатів шляхом продукції рекомбінантних білків з точковими мутаціями у позиції Asn35 та Arg81. Здатність до зв’язування 3-АЕСК у рекомбінантних білків Asn35Gly та Arg81Leu була суттєво зниженою. Отримані дані вказують на те що взаємодія гліцеральдегід 3-фосфатдегідрогенази з СК відбувається за участю згаданих амінокислотних залишків на поверхні білку. Також було показано, що СК пригнічує ферментативну активність GAPA1 in vitro. Шляхом порівняння просторових структур GAPA1 у комплексі з кофактором НАДФ та у комплексі зв’язування з СК, було встановлено що дані взаємодії просторово накладаються – СК взаємодіє з GAPA1 у місці зв’язування аденінової частини кофактору НАДФ. Таким чином, вплив СК на активність гліцеральдегід 3-фосфатдегідрогенази GAPA1 з Arabidopsis thaliana реалізується шляхом зв’язування з білок на рівні амінокислотних залишків Asn35 та Arg81 що запобігає приєднанню кофактору НАДФ. Опис продукції Автори роботи Покотило Ігор В'ячеславович Додано в НРАТ 2020-12-23 Закрити