Реєстраційний номер
0221U106051,
0114U006257
, Науково-дослідна робота
Назва роботи
Адаптивна трансляція і механізми корекції помилок аміноацил-тРНК синтетазами in vitro та in vivo
Назва етапу роботи
Керівник роботи
Тукало Михайло Арсентійович, Доктор біологічних наук
Дата реєстрації
04-10-2021
Організація виконавець
Інститут молекулярної біології і генетики Національної академії наук України
Опис етапу
Показано, що редагувальна активність корегувального домену архейної лейцил-тРНК синтетази із M. thermoautotrophicus спрямована проти природних непротеїногенних аналогів лейцину (норваліну і норлейцину).
З використанням обчислювальних та біохімічних методів виявлено два нових субстрат-асистованих механізми гідролізу помилково аміноацильованої тРНК в редагуювальному активному центрі прокаріотної лейцил-тРНК синтетази із Thermus thermophiles.
На основі даних молекулярної динаміки запропоновано механізм пост-трансферного гідролізу Nva-A76 в LeuRSPh архей, що схожий на 2-й представлений механізм для LeuRSTt.
Розроблена модель вивчення помилкового включення норваліну на місце лейцину в білки E.coli на основі штаму з пошкодженою редакційною активністю лейцил-тРНК синтетази та вперше показана можливість ідентифікації помилкового включення норваліну замість лейцину на рівні повного протеому E.coli.
Показано, що вивчення включення in vivo норваліну (замість лейцину) в різні білки E. coli в умовах його підвищеної концентрації в середовищі показало є вибірковим і в переважній більшості проходить в так звані несуттєві для життєдіяльності бактерії білки.
З використанням біохімічних та обчислювальних методів ідентифіковано новий субстрат-асистований механізм гідролізу D-тирозил-тРНКTyr ДТДТТ в якому кілька функціональних елементів помилково ацильованої тРНК приймають безпосередню участь у каталізі.
Вперше для аміноацил-тРНК синтетаз показано, що редагувальний домен аланіл-тРНК синтетази відповідає за контроль стереоспецифічності у процесі біосинтезу білка.
Отримані результати можуть бути використані для подальших фундаментальних наукових досліджень та розробки інгібіторів ферментів біосинтезу білків патогенними мікроорганізмами і лікарських засобів проти ракових пухлин.
Опис продукції
Автори роботи
Гудзеpа Ольга Йосипівна
Коваленко Оксана Петрівна
Крикливий Іван Андрійович
Рибак Марія Юріївна
Яремчук Ганна Дмитрівна
Додано/оновлено в НРАТ
2021-10-04
