Пошук академічних текстів

Інформація × Реєстраційний номер 0221U106658, 0121U114001 , Науково-дослідна робота Назва роботи Нові низькомолекулярні біорегулятори як ефективні агенти проти мультирезистентних клінічних ізолятів Acinetobacter baumannii у дослідженнях in silico та in vitro Назва етапу роботи Керівник роботи Метелиця Лариса Олексіївна, к.б.н. Дата реєстрації 16-12-2021 Організація виконавець Інститут біоорганічної хімії та нафтохімії ім. В. П. Кухаря Національної академії наук України Опис етапу  За допомогою Веб-платформи OCHEM за використання різних методів машинного навчання та широкого спектру молекулярних дескрипторів побудовано ряд QSAR-моделей для передбачення біологічної активності іонних рідин проти A. baumannii. Розроблені QSAR-моделі продемонстрували високу стабільність, надійність, прогностичну здатність та можуть бути використані для пошуку та конструювання нових інгібіторів A. baumannii з відповідним типом структурних особливостей. За допомогою розроблених QSAR-моделей ідентифіковано для експериментального тестування ряд іонних рідин з високою потенційною активністю проти A. baumannii. Отримані результати дозволяють рекомендувати вісім імідазолієвих та піридинієвих іонних рідин, а також ряд фосфонієвих для подальшого вивчення як перспективних антибактеріальних агентів. In silico дослідження потенційної токсичності перспективних з точки зору антибактеріальної активності сполук дозволили класифікувати їх як практично нетоксичні та малотоксичні хімічні об’єкти. Методом молекулярного докінгу встановлено, що потенційною мішенню досліджених іонних рідин є триклозан-зв'язуючий регіон FabI A. baumannii. Комлексоутворення досліджених лігандів супроводжувалося розрахованими енергіями зв’язування в діапазоні від - 6,5 ккал/моль до - 6,72 ккал/моль. Отримані in silico константи інгібування лігандів складали від 11,92 мкМ до 13,55 мкМ. Ключова роль у комплексоутворенні належить амінокислотам ALA95, TYR147 (TYR149), ALA199 та кофактору НАДФ. Іонні рідини 1-додецилпіридиніум хлорид, 1-тетрадецилпіридиніум бромід та 1-(2-гідроксиетил)-3-додецилімідазоліум хлорид, а також броміди октилтрифенілфосфонію, децилтрифенілфосфонію та додецилтрифенілфос-фонію та броміди децилтрибутилфосфонію і додецилтрибутилфосфонію представляються перспективними антибактеріальними агентами проти антибіотикорезистентних штамів A. baumannii. Опис продукції Автори роботи Година Діана Миколаївна Ковалішин Василь Володимирович Рогальський Сергій Петрович Семенюта Іван Володимирович Додано в НРАТ 2021-12-16 Закрити