Пошук академічних текстів

Інформація × Реєстраційний номер 0221U106929, 0120U104795 , Науково-дослідна робота Назва роботи Сайт-спрямований мутагенез як інноваційний підхід для дослідження механізмів виникнення та подолання резистентності Mycobacterium tuberculosis до антибіотиків Назва етапу роботи Керівник роботи Ярмолюк Сергій Миколайович, Доктор хімічних наук Дата реєстрації 22-12-2021 Організація виконавець Інститут молекулярної біології і генетики Національної академії наук України Опис етапу  Вперше проведено розрахунок вільної енергії зв’язування дикої та дев’яти мутованих форм метіоніл-тРНК синтетази (МетРС) M. tuberculosis I10A, Y12A, E24A, D49A, K54A, D263A, H290A, L293A, F292A з лігандом – негідролізованим аналогом метіоніл-аденілату, за допомогою молекулярної динаміки з використанням алгоритму umbrella sampling. За результатами розрахунків відібрано два амінокислотні залишки – Glu24 та Leu293, для експериментального сайт-спрямованого мутагенезу. Одержано рекомбінантні аналоги МетРС та ЛейРС M. tuberculosis у препаративних кількостях. Побудовано моделі штучних нейронних мереж для пошуку більш ефективних інгібіторів МетРС та ЛейРС M. tuberculosis. ROC-скор для моделей ЛейРС був у межах 0,91 – 0,95. ROC-скор для моделей МетРС був у межах 0,91 – 0,97. Серед 100 сполук, що були відібрані методом машинного навчання у результаті біохімічного тестування знайдено 17 нових інгібіторів МетРС та 15 нових інгібіторів ЛейРС, що пригнічують активність ензимів більше, ніж на 50% при концентрації 100 µM. Проведено оптимізацію інгібіторів із подвійною інгібувальною активністю щодо МетРС та ЛейРС M. tuberculosis серед похідних 2-(хінолін-2-ілсульфаніл)-ацетаміду. Серед 10 синтезованих аналогів цього класу ідентифіковано 8 інгібіторів МетРС, що пригнічують ензим в діапазоні від 29% до 88% при концентрації 50 µM та 10 інгібіторів ЛейРС, що пригнічують ензим в діапазоні від 26% до 94% при концентрації 50 µM. Встановлено, що сполука 2-[2-(6-хлоро-4-метил-хінолін-2-ілсульфаніл)-ацетиламіно]-5-феніл-тіофен-3-карбоксильної кислоти амід проявляє інгібувальну активність одночасно до МетРС та ЛейРС M. tuberculosis зі значеннями ІС50 = 33±16 µM та 23,9±2,5 µM, відповідно. Опис продукції Автори роботи Додано в НРАТ 2021-12-22 Закрити