Реєстраційний номер
0226U001142,
(0124U002143)
, Науково-дослідна робота
Назва роботи
Дослідження неензиматичної активації протромбіну
Назва етапу роботи
In silico пошук низькомолекулярних сполук, здатних взаємодіяти з активаційної «Ile16»-коміркою протромбіну. Дослідження здатності отриманих сполук активувати протромбін. Пошук сайтів взаємоії стафілокоагулази і протромбіну для пошуку додаткових регуляторних сайтів взаємодії.
Керівник роботи
Комаров Ігор Володимирович, Доктор хімічних наук
Чернишенко Володимир Олександрович, Доктор біологічних наук
Дата реєстрації
21-01-2026
Організація виконавець
Державна організація "Відділення цільової підготовки Київського національного університету імені Тараса Шевченка при Національній академії наук України"
Опис роботи
Метою роботи є дослідження особливостей неензиматичної активації протромбіну, а також пошук пептидів та/або низькомолекулярних сполук, які потенційно здатні неензиматично активувати протромбін.
Опис етапу
Предмет дослідження - неензиматична активація протромбіну, яка полягає у експонуванні тромбін-подібного активного центру в молекулі протромбіну без протеолітичної модифікації. Проведено пошук потенційних лігандів активаційної «Ile16»-комірки протромбіну з використанням методів in silico. Синтезовано додаткову низку пептидів, які за даними in silico здатні взаємодіяти з активаційною коміркою протромбіну; перевірено дію отриманих пептидів на процес активації протромбіну. Для визначення тромбін-подібної активності використано хромогенний субстрат тромбіну S2238. Для доведення комплексоутворення пептиду-активатора з протромбіном було здійснено синтез флуорисцентного похідного найактивнішого пептиду-активатора. Цей пептид – IIVSDW3SKE – містить неприродню амінокислоту, яка обумовлює ESIPT- опосередковані флуоресцентні властивості. Хроматографічне дослідження показало резонансне перенесення енергії в системі протромбін-активаційний пептид з флуоресцентною міткою, що свідчить про їх взаємодію. Досліди з титрування протромбіну розчином даного пептиду проводили з використанням термостатованої комірки спектрофлуориметру при температурах 25 та 37oC. В обох температурних режимах реєструвалось істотне зниження власної флуоресценції протромбіну з кожним наступним внесеним об’ємом пептиду, що свідчить про чутливість методу флуоресцентної спектроскопії для реєстрації міжмолекулярної взаємодії в системі протромбін - досліджуваний пептид. У ході in silico дослідження низькомолекулярних сполук було визначено їх основні характеристики – наявність позитивно-зарядженої донорної групи, що формує сольовий місток і водневі зв’язки з Asp194, також важливою була наявність гідрофобних груп, як циклічних, так і аліфатичних, занурених в Ile16-комірку. Основними результатами роботи є віднайдення та синтез пептидів, які здатні неензиматично активувати протромбін, що доведено комплексоутвореням між ними та характеристика низькомолекулярних сполук, які теж потенційно проявляють таку ж активність.
Опис продукції
Автори роботи
Цуварєв Олександр Юрійович
Грабовський Олексій Олегович
Павленко Анастасія Олександрівна
Шевченко Єва Вікторівна
Липенко Олексій Сергійович
Савченко Ілля Іванович
Додано/оновлено в НРАТ
2026-01-21
