Звіт по науково-дослідній роботі. Горб Леонід Григорович. Динамічна структура нуклеїнових кислот і механізми їх взаємодії з біологічно активними речовинами

Реєстраційний номер

0226U004543, (0126U004259) , Науково-дослідна робота

Назва роботи

Динамічна структура нуклеїнових кислот і механізми їх взаємодії з біологічно активними речовинами

Назва етапу роботи

Вивчити in silico особливості переносу протону від тиміну до аденіну у міні-спіралі, яка має будову dА5∙dТ5 Дослідити in silico та in vivo взаємодію кварцетину, лютеолину, апигеніну та їх алкілованих похідних з вірусними мішенями, такими як: helicase, pappiloma virus, helicase HCV, PB2 influenza та нейрамінідаза вірусу грипу. Виявити закономірності структура-функція. Вивчити in silico первинну та вторинну структури сайту геномної РНК ВІЛ-1, яка регулює процес стабілізації мРНК.

Керівник роботи

Горб Леонід Григорович, Доктор хімічних наук

Дата реєстрації

24-09-2026

Організація виконавець

Інститут молекулярної біології і генетики Національної академії наук України

Опис роботи

1. Вивчення особливості переносу протону від цітозину до гуаніну у міні-спіралі, яка має будову dG5∙dC5. 2. Визначення стабільність комплексів, отриманих шляхом високопродуктивного віртуального скринінгу, та оцініти їхні енергетичні параметри. 3. Провести широкомасштабне дослідження вторинної структури ділянки геному ВІЛ-1, що містить сайт PBS, у геномах різних субтипів.

Опис етапу

Об’єкт дослідження – структура нуклеїнові кислот і механізми їх взаємодії з біологічно активними речовинами. Мета роботи Вивчити in silico особливості переносу протону від тиміну до аденіну у міні-спіралі, яка має будову dА5∙dТ5 Дослідити in silico та in vivo взаємодію кварцетину, лютеолину, апигеніну та їх алкілованих похідних з вірусними мішенями, такими як: helicase, pappiloma virus, helicase HCV, PB2 influenza та нейрамінідаза вірусу грипу. Виявити закономірності структура-функція. Вивчити in silico первинну та вторинну структури сайту геномної РНК ВІЛ-1, яка регулює процес стабілізації мРНК. Методи дослідження Програмний пакет для моделювання Gaussian 16, програмний пакета 3DNA, бази даних NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/) та HIV sequence database of Los Alamos National Laboratory, (http://www.hiv.lanl.gov/), програма UNAFold. Результати Сучасні уявлення про динамічну структуру нуклеїнових кислот розширені першими теоретичними даними про механізм таутомеризації АТ пари у міні-спіралі ДНК d(A)5∙d(T)5, яка мала В-форму, а також даними про вторинну структуру С-багатих трактів приблизно 5000 геномів ВІЛ-1 різних субтипів. Експериментально і розрахунково показана здатність кверцетину, лютеолину, апигеніну взаємодіяти з вірусними мішенями РВ2 (домен вірусної полімерази грипу) і NS3 гелікази (домен HPV – Human Papillomavirus).

Опис продукції

Автори роботи

Ширина Тетяна Володимирівна
Войтешенко Іван Сергійович
Степанюгін Андрій Васильович
Гурмач Василь Васильович
Пальчиковська Лариса Гнатівна
Платонов Максим Олегович
Зарудна Маргарита Іванівна

Додано/оновлено в НРАТ

2026-09-24