Search academic texts

Information × Registration Number 0415U003317, Candidate dissertation Status к.б.н. Date 28-04-2015 popup.evolution o Title Characterization of glioblastoma molecular marker CHI3L1 and glioblastoma grouping on the basis of gene expression Author Iershov Anton Viktorovych, popup.head Dmytrenko Volodymyr Volodymyrovych popup.opponent Матишевська Ольга Павлівна popup.opponent Солдаткіна Марія Олександрівна Description Дисертація присвячена характеристиці механізмів регуляції експресії гена CHI3L1, надекспресованого в гліобластомах, і визначенню особливостей його функціонування, а також типуванню гліобластом за профілем експресії генів. В ході роботи встановлено, що у хворих з первинними гліобластомами, G/G-гомозиготних за однонуклеотидним поліморфізмом -131C->G в промоторі CHI3L1, наявна тенденція до зменшення експресії CHI3L1. Було досліджено вплив транскрипційного фактору p53 на продукцію CHI3L1 і показано, що експресія CHI3L1 в клітинах лінії U87, що походять з гліобластоми, може бути знижена за рахунок надекспресії TP53, активації протеїна p53 або через блокування його деградації. Встановлено, що інгібування деацетилази гістонів SIRT1 знижує експресію CHI3L1 в клітинах U87. Порівнянням структур двох гомологічних протеїнів, що мають протилежний вплив на проліферацію клітин: просторової моделі CHI3L2, отриманої моделюванням за гомологією, зі структурою CHI3L1 показано, що CHI3L1 має дві відмінні функціональні одиниці - реорганізований ліганд-зв'язуючий сайт і поверхневий позитивно заряджений гепарин-зв'язуючий мотив. За допомогою сайт-спрямованого мутагенезу встановлено, що протеїн CHI3L1 зв'язується з гепарином через кластер позитивно заряджених амінокислот на поверхні протеїна, і цей гепарин-зв'язуючий сайт може бути відповідальним за субстрат-незалежний ріст клітин 293 з надпродукцією CHI3L1. Розроблено підхід субтипування гліобластом, який полягає в об'єднанні даних генної експресії з різних робіт, визначенні числа груп в масиві даних, проведенні кластерного аналізу та перевірці результатів за допомогою незалежного методу - нейромережевого аналізу. За профілем експресії обраних в даній роботі 416 генів визначено два підтипи гліобластом, "проліферативний" та "пронейральний", які можуть відображати особливості їхнього розвитку. Типування гліобластом за профілем експресії генів в подальшому може допомогти розробити стратегії їхнього лікування. Registration Date 2015-04-28 popup.nrat_date 2020-04-03 Close