Search academic texts

Information × Registration Number 0425U000295, Candidate dissertation Status Кандидат біологічних наук Date 30-09-2025 popup.evolution . Title A specialized database of gene expression in the uterine-placental complex, maternal and fetal blood, and the placental transcriptome throughout physiological pregnancy. Author Oleksandr . K. Lykhenko, popup.head Mariya Obolenska popup.opponent Andrei V. Sivolob popup.opponent Pavlo A. Karpov Description Роботу присвячено створенню спеціалізованої бази даних з генної експресії у зразках матково-плацентарного комплексу та крові матері й плода та інтегративному аналізу транскриптому плаценти упродовж нормального перебігу вагітності. Використано відкриті дані з генної експресії, накопичені у репозиторіях Gene Expression Omnibus (GEO) та ArrayExpress для проведення вторинного аналізу об’єднаних однотипних даних, що збільшує об’єм вибірки і статистичну значущість результатів аналізу. Було відібрано, стандартизовано і розширено метадані для зразків в матково-плацентарному комплексі та крові матері й плоду з охарактеризованою генною експресією технологією мікромасивів. Проведно категоризацію метаданих за онтологіями MeSH і EFO і використано програмні засоби Pyhton/Django/Postgres для розробки і створення спеціалізованої реляційної бази метаданих даних IGEА. База уможливлює простий та швидкий відбір датасетів за обраними користувачем характеристиками зразків. Дані генної експресії обраних з бази IGEA датасетів восьми досліджень цілісної тканини плаценти першого, другого та третього триместрів було об’єднано й утворено принципово новий інтегрований датасет. Вперше кількісно охарактеризовано зміни експресії 253 генів між першим і другим та 489 генів між другим і третім триместрами вагітності. Перший часовий інтервал характеризується активними імунними і захисними реакціями, диференціюванням клітин і ростом органу, прозапальними процесами і підтриманням взаємної толерантності у ділянці зіткненням плодової частини плаценти з децидуальною тканиною матері. Другий часовий інтервал характеризується суттєвим зменшенням прозапальних процесів, на заміну яким приходять протизапальні процеси, зменшення проліферативної активності й активності морфогенів і генів комітування та активація метаболічних процесів, характерних для високодиференційованої тканини. У другому триместрі вперше показано й кількісно охарактеризовано переломний момент в експресії численних генів, напрямок експресії від першого до другого триместру змінюється на протилежний від другого до третього триместру. Серед таких генів є, наприклад, поліфункціональний ген лептину (LEP), експресія якого знижується від першого до другого триместру і підвищується від другого до третього триместру. Лептин є потенційним маркером прееклампсії. Переломний момент в експресії генів збігається в часі з першим проявом клінічних симптомів, що не виключає залежності клінічних симптомів від дисфункції генів, напрямок експресії яких різний у першій і другій половинах вагітності. Вперше описано чотири універсальні траєкторії ко-експресії генів («Up-Up», «Up-Down», «Down-Down», «Down-Up») та три характерні схеми взаємодії ДЕГів у межах біологічного процесу: взаємне виключення (наприклад, прозапальні хемокін проти гомеостатичних), синергія (активація активаторів морфогенезу з одночасним інгібуванням їх антагоністів та активація інгібінів призводить до специфічного інгібування активінів і пригнічення морфогенетичних процесів). Registration Date 2025-09-24 popup.nrat_date 2025-09-24 Close