Реєстраційний номер
0521U101517, Докторська дисертація
На здобуття
Доктор біологічних наук
Дата захисту
12-05-2021
Статус
Захищена
Назва роботи
Поліморфізм довжини інтронів генів білків цитоскелету як ефективний інструмент генотипування рослин
Здобувач
Пірко Ярослав Васильович, Кандидат біологічних наук
Керівник Блюм Ярослав Борисович
Керівник Блюм Ярослав Борисович
Керівник Блюм Ярослав Борисович
Керівник Блюм Ярослав Борисович
Керівник Блюм Ярослав Борисович
Керівник Блюм Ярослав Борисович
Консультант Блюм Ярослав Борисович
Консультант Блюм Ярослав Борисович
Консультант Блюм Ярослав Борисович
Консультант Блюм Ярослав Борисович
Консультант Блюм Ярослав Борисович
Консультант Блюм Ярослав Борисович
Опонент Терновська Тамара Костянтинівна
Опонент Волкова Наталія Едуардівна
Опонент Дробик Надія Михайлівна
Установа, організація, у вченій раді якої відбудеться/відбувся захист
Державна установа "Інститут харчової біотехнології та геноміки Національної академії наук України"
Опис
исертаційне дослідження присвячено розробленню та впровадженню молекулярно-генетичних маркерів, що ґрунтуються на використанні поліморфізму інтронів генів білків цитоскелету (α-, β-, γ-тубулін та актин) для генетичної диференціації та генотипування рослин. Зокрема проведено аналіз існуючих геномних баз даних рослин на наявність послідовностей генів, що кодують α-, β-, γ-тубулін та актин. Досліджено їх екзон-інтронну структуру, здійснено вирівнювання послідовностей з метою отримання консенсусних послідовностей та підбір праймерів до консервативних ділянок геномів, що оточують інтрони генів. Підібрано як видоспецифічні, так і універсальні (що можуть бути використані у дослідженні багатьох видів рослин) вироджені праймери. Оцінено поліморфізм інтронів генів α-, β-, γ-тубулінів та актину на видовому, популяційному, сортовому та внутрішньосортовому рівнях у різних видів рослин. На підставі результатів аналізу поліморфізму інтронів генів α-, β-, γ-тубулінів та актину проведено генетичне профілювання таких господарсько цінних видів рослин, як льон-довгунець, рис посівний, пшениця, ячмінь, томат та картопля. Також завдяки оцінці поліморфізму довжини інтронів генів β-тубуліну та актину досліджено генетичну мінливість та диференційовано природні популяції егілопсів Aegilops biuncialis з Кримського півострову. Використовуючи аналіз поліморфізму інтронів генів актину та α-тубуліну генотиповано сорти томату (Solanum lycopersicum) та картоплі (Solanum tuberosum), отримано специфічні ДНК-профілі досліджених сортів. Оцінений міжсортовий та внутрішньосортовий поліморфізм довжини інтронів генів β-тубуліну та актину у різних сортів льону-довгунця. Показана висока ефективність використання ILP–маркерів, що базуються на оцінці поліморфізму інтронів генів цитоскелетних білків у порівнянні з SSR-маркерами на прикладі аналізу родів Linum L., Quercus L., Ulmus L. Продемонстровано зручність та надійність застосування методу ТВР-аналізу для молекулярно-генетичного маркування трав’янистих та деревних рослин, а також для вивчення окремих аспектів внутрішньовидового поліморфізму господарчо цінних, садово-паркових та лісоутворюючих порід. За допомогою ТВР-методу ідентифіковано унікальні патерни для 20 деревних видів рослин та створено молекулярні профілі кожного з цих видів. Вперше отримано специфічні ТВР-профілі мікроводоростей, які дозволили чітко диференціювати генотипи на різних таксономічних рівнях та підтвердити однорідність окремих зразків, що належать до одного штаму.
Дата реєстрації
2021-05-31
Додано/оновлено в НРАТ
2021-05-31 / 2026-06-30
