Пошук академічних текстів

Інформація × Реєстраційний номер 0825U000920, Дисертація доктора філософії На здобуття Доктор філософії Дата захисту 24-04-2025 Статус Наказ про видачу диплома Назва роботи Моделювання коливальної динамiки iон-гiдратної оболонки подвiйної спiралi ДНК Здобувач Бубон Тетяна Леонідівна, Керівник Перепелиця Сергій Миколайович Опонент Ніколаєнко Тимофій Юрійович Опонент Шестопалова Ганна Вікторівна Рецензент Брижик Лариса Свиридівна Рецензент Капітанчук Олексій Леонідович Опис В умовах живої клiтини молекула ДНК приймає форму подвiйної спiралi, що складається з двох ланцюгiв нуклеотидiв, закручених один навколо одного. Гiдрофобнi нуклеїновi основи нуклеотидiв утворюють комплементарнi пари, зв’язанi водневими зв’язками всерединi макромолекули, уникаючи контакту з молекулами води. Аденiн (А) зв’язується з тимiном (Т), а гуанiн (G) з цитозином (С). Негативно зарядженi фосфатнi групи остова подвiйної спiралi знаходяться ззовнi подвiйної спiралi та оберненi до розчину. Фосфатнi групи ДНК нейтралiзуються позитивно зарядженими iонами металiв (Na⁺, K⁺, Mg²⁺) або молекулярними iонами (полiамiни). Нейтралiзуючi iони називають протийонами. Починаючи з перших дослiджень структури молекули ДНК було показано, що iон-гiдратне середовище стабiлiзує структуру макромолекули. Динамiка подвiйної спiралi ДНК та її iон-гiдратного оточення взаємопов’язанi, що є також визначальним для механiзмiв бiлково-нуклеїнового розпiзнавання та взаємодiї ДНК з бiологiчно активними сполуками. Визначальна роль iон-гiдратної оболонки ДНК робить її дослiдження ключовим для розумiння фiзичних механiзмiв функцiонування самої макромолекули. На сьогоднi вивчення властивостей iон-гiдратної оболонки ДНК є актуальною проблемою, про що свiдчить низка робiт, в яких дослiджуються структурнi та динамiчнi властивостi iонiв та молекул води навколо подвiйної спiралi. Одним iз важливих питань для опису динамiчної характеристики системи ДНК-вода-iони є дослiдження саме коливальної динамiки молекул води та протийонiв бiля сайтiв зв’язування з атомними групами ДНК, що може займати визначальне мiсце для бiологiчних процесiв в системi. Наявнi експериментальнi методи можуть надати коливальнi спектри, в яких проявляються моди коливань структурних елементiв систем ДНК-вода-iони, аналiз та вивчення яких є важливим для характеристики їх структури та динамiки. Однак все ще доволi складно видiлити й описати характер мод коливань молекул води та протийонiв iон-гiдратної оболонки ДНК, що безпосередньо взаємодiють з подвiйною спiраллю та лежать у низькочастотному дiапазонi спектра (< 400 см⁻¹). У дисертацiйнiй роботi була дослiджена коливальна динамiка iон-гiдратної оболонки ДНК, використовуючи теоретичний пiдхiд та комп’ютернi симуляцiї. Був проведений аналiз для вивчення коливальної динамiки молекул води та протийонiв лужних металiв iон-гiдратної оболонки ДНК. Визначено вплив окремих протийонiв на динамiку молекул води гiдратної оболонки подвiйної спiралi. Виявлено вплив характеру гiдратацiї протийонiв i структурної органiзацiї молекул води в рiзних областях подвiйної спiралi. Дата реєстрації 2025-03-18 Додано в НРАТ 2025-03-18 Закрити