Пошук академічних текстів

Інформація × Реєстраційний номер 0825U002937, Дисертація доктора філософії На здобуття Доктор філософії Дата захисту 05-09-2025 Статус Запланована Назва роботи Біоінформатичний аналіз і моделювання комплексу білків, відповідальних за асоціацію фагосоми з мікротрубочками рослинної клітини Здобувач Булгаков Ілля Володимирович, Керівник Блюм Ярослав Борисович Опонент Нипорко Олексій Юрійович Опонент Шевченко Галина Валеріївна Рецензент Бузіашвілі Анастасія Юріївна Рецензент Рабоконь Анастасія Миколаївна Опис Дисертаційна робота присвячена формуванню уявлення про перебіг та ключові ланки процесу ініціації аутофагії у рослин на прикладі A.thaliana; визначенню подібності рослинних білків до більш відомих гомологів або ортологів з клітин тварин та дріжджів; моделюванню низки ATG білків з подальшим передбаченням організації їх у комплекси in silico; встановленню особливостей міжбілкових взаємодій із можливим підтвердженням стабільності досліджуваних мультимерних комплексів, що передують збиранню PAS–преаутофагосомної структури на етапі ініціації аутофагії. У роботі визначено тривимірні структури ключових білків, пов’язаних із ініціацією аутофагії в клітинах A. thaliana. Методами in silico ідентифіковано основні ділянки взаємодії між білками ATG та їхніми платформами (мембранами, мікротрубочками), а також проаналізовано вплив ацетилювання на ATG8 та тубуліни. Розроблено комп’ютерні моделі та протоколи для подальшого дослідження механізмів посттрансляційних модифікацій. Визначено та валідовані на різних об’єктах, із кореляцією відносно експериментальних даних, оптимальні параметри різних біоінформатичних інструментів та необхідні налаштування для процедур докінгу, симуляцій. Алгоритми штучного інтелекту були використані для перехресної валідації перед проведенням всебічної перевірки молекулярної динаміки. В результаті було створено набір оптимізованих білкових конструкцій для моделювання білкових взаємодій та аналізу молекулярної рухливості за допомогою методів in silico. Дата реєстрації 2025-07-14 Додано в НРАТ 2025-07-14 Закрити