Реєстраційний номер
0826U005084, Дисертація доктора філософії
На здобуття
Доктор філософії
Дата захисту
17-09-2026
Статус
Наказ про видачу диплома
Назва роботи
Моніторинг SARS-COV-2 серед домашніх тварин та розроблення методів діагностики
Здобувач
Моложанова Альона Василівна,
Керівник Тарасов Олександр Анатолійович
Опонент Радзиховський Микола Леонідович
Опонент Коваленко Вячеслав Леонідович
Опонент Юрко Поліна Сергіївна
Рецензент Скрипник Валерій Григорович
Установа, організація, у вченій раді якої відбудеться/відбувся захист
Інститут ветеринарної медицини Національної академії аграрних наук України
Опис
Дисертаційну роботу присвячено моніторингу SARS-CoV-2 серед різних видів домашніх тварин в Україні, оцінці їх можливої ролі як резервуару вірусу, розробленню діагностичного набору на основі петлевої ізотермічної ампліфікації (LAMP) та дослідженню генетичної варіабельності SARS-CoV-2 із застосуванням повногеномного секвенування методом NGS.
На першому етапі проведено епідеміологічний аналіз поширення COVID-19 в Україні та визначено території для відбору біологічного матеріалу. Розроблено стандартну операційну процедуру щодо відбору, транспортування, зберігання та знищення зразків від тварин для дослідження на SARS-CoV-2. У шести областях України (Львівській, Тернопільській, Хмельницькій, Полтавській, Чернігівській та Житомирській) відібрано 1214 зразків від домашніх і продуктивних тварин, зокрема собак, котів, кролів, свиней, овець, кіз, великої рогатої худоби та коней. Дослідження проводили методом RT-qPCR. За результатами аналізу SARS-CoV-2 у досліджених зразках не виявлено, що дозволило припустити відсутність резервуарної ролі досліджених видів домашніх тварин у досліджених регіонах.
Для розроблення та оптимізації RT-LAMP використано 25 зразків РНК SARS-CoV-2, наданих Центром громадського здоров’я МОЗ України. Підібрано праймери до ділянок N- та S-генів вірусу, оптимізовано умови ампліфікації та проведено внутрішньолабораторну валідацію. Оптимальні умови реакції становили 64 °С протягом 30 хв. Специфічність RT-LAMP для N-гену становила 99,4 %, чутливість для зразків із Ct<30 — 98,5 %; для S-гену — 92,8 % і 96,8 %, відповідно. Для RT-LAMP із колориметричною оцінкою результатів специфічність становила 85,7 % для N-гену та 75,0 % для S-гену, а чутливість — 98,5 % для обох генів. Встановлено відсутність перехресних реакцій із дослідженими сторонніми вірусними збудниками, що підтверджує аналітичну специфічність розробленої тест-системи.
Проведено повногеномне секвенування восьми ізолятів SARS-CoV-2. Серед них виявлено п’ять субліній варіанту Delta: AY.33, AY.36, AY.122, B.1.617.2 та AY.4.2, а також один ізолят варіанту Alpha (B.1.1.7).
За результатами досліджень розроблено методичні рекомендації з виявлення SARS-CoV-2 методом LAMP. Отримані результати використовуються в лабораторній діагностиці та освітньому процесі, а також для підвищення кваліфікації фахівців ветеринарної медицини.
Ключові слова: вірус SARS-COV-2, відбір зразків, діагностика, тварини, полімеразна ланцюгова реакція, ПЛР, LAMP, повногеномне секвенування, філогенетика.
Дата реєстрації
2026-09-03
Додано/оновлено в НРАТ
2026-09-03 / 2026-10-05
