Реєстраційний номер
0212U009040,
0111U005988
, Науково-дослідна робота
Назва роботи
Макромолекули та їх комплекси в реалізації генетичної інформації
Назва етапу роботи
Керівник роботи
Єльська Ганна Валентинівна, Доктор біологічних наук
Дата реєстрації
27-12-2012
Організація виконавець
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Опис етапу
З використанням сучасних методів обчислювальної біології, досліджено біологічно важливі молекулярні системи, такі як Вотсон-Криківська пара основ A•T і пари основ за участю гіпоксантину (Hyp). Аналізуючи енергетичну залежність кожного з трьох водневих зв'язків, які стабілізують Вотсон-Криківську і Льовдінівську пари, вздовж IRC, встановлено, що всі Н-зв'язки у парі основ A•T є кооперативними, взаємно підсилюючи один одного, в той час як H-зв'язок C2H…O2 в парі основ А*•Т* поводить себе антикооперативно, послаблюючись при підсиленні двох інших. Отримані і проаналізовані кристали eEF1A дріжджів в комплексі із фрагментом фактора нуклеотидного обміну. Усі ці структури допомогли в розумінні молекулярних деталей функціонування EF1A в еубактеріях і архебактеріях і сприяли пролиттю певного світла на процес елонгації в нижчих евкаріотах. Зокрема, спостерігалася різниця в X-ray структурах aEF1A і eEF1AyoeEF1Bab, але залишалося незрозумілим, чи ця різниця відображає дійсні розбіжності між архебактерійним і евкаріотним білками, чи вона є результатом різниці між ГДФ-, ГТФ- конформаціями та конформацією eEF1A в комплексі з фактором нуклеотидного обміну. Кристали eEF1A вищих евкаріотів до цього часу були відсутні.Було досліджено експресію онкогенних та онкосупресорних мікроРНК. Показано, що при світлоклітинній карциномі нирок рівень експресії miR-21 і miR-222 значно вищий, ніж у відповідних нормальних тканинах (в 1,3 - 34 рази для miR-21 та в 6-19 разів для miR-222). Визначення змін у експресії цих онкогенних микроРНК може бути використано в якості біомаркера даної онкопатології. Нами виявлено суттєве зниження експресії miR-218 в клітинах злоякісних пухлин молочної залози у порівнянні зі зразками відповідної нормальної тканини та кореляцію між експресією онкосупресорної miR-218 і мРНК GLCE або відповідного білка. Таким чином, інактивація miR-218 може відігравати роль у розвитку раку молочної залози. Нашими попередніми дослідженнями показаний протективний ефект заглушення гену, що кодує 5-ліпоксигеназу при ішемії-реперфузії міокарда. Також незаперечною є роль мікроРНК у механізмах як пошкодження міокарда, так і кардіопротекції. Виявлена взаємодія між 5-ліпоксигеназою та системою матурації-мікроРНК стимулювала наші дослідження експресії мікроРНК, специфічних для серця (мікроРНК-1, -29а та -208а) при заглушенні гену 5-ліпоксигенази. Отримані дані свідчать про вибірковість впливу заглушення 5-ліпоксигенази на матурацію мікроРНК: знижується для мікроРНК-1, збільшується для мікроРНК-208а та не змінюється для мікроРНК-29а
Опис продукції
Вивчено різнорідні структурні властивості макромолекулярних комплексів та їх компонентів, пов’язані з виконанням ними своїх біологічних функцій. Здійснено структурно-функціональний аналіз макромолекулярних комплексів, залучених до каталізу ДНК полімерази, редагування аатРНК-синтетаз, елонгації трансляції, ізоформ S6K, метилювання геному та процесів реоксигінації.
Автори роботи
Б.С.Негруцький
В.Є.Досенко
В.І.Кашуба, д.б.н.
В.В.Філоненко
Г.В.Єльська
Г.Д.Яремчук
Д.М.Говорун
Л.Г.Горб
М.А.Тукало
П.В.Білан
Додано/оновлено в НРАТ
2020-04-02
