Реєстраційний номер
0221U100911,
0116U000237
, Науково-дослідна робота
Назва роботи
Встановити видо- та родоспецифічні генетичні маркери збудників емерджентних інфекційних захворювань ВРХ, свиней, птиці та розробити методологію їх моніторингу і діагностики на основі молекулярно-генетичних технологій
Назва етапу роботи
Керівник роботи
Герілович Антон Павлович,
Дата реєстрації
11-01-2021
Організація виконавець
Національний науковий центр "Інститут експериментальної і клінічної ветеринарної медицини"
Опис етапу
Сформовано бази даних секвенованих послідовностей геномного матеріалу, основних генів та їх фрагментів ізолятів вірусів ньюкаслської хвороби, африканської чуми свиней, вірусу хвороби Шмалленберга, вірусу блютангу, циркулюючих у різних географічних регіонах світу. Проведено секвенування гена F для 34 ізолятів вірусу ньюкаслської хвороби, циркулюючих на території України. Встановлено належність трьох ізолятів даного збудника до класу І, а решти - до класу ІІ. Вивчено філогенетичні взаємовідносини українських ізолятів вірусу ньюкаслської хвороби. Встановлено їх належність до генотипів Іс, Іb, II, VIa, VIc, VIg,VIId. Розроблено методику для ідентифікації вірусу ньюкаслської хвороби класу І та класу ІІ шляхом мультиплексної полімеразної ланцюгової реакції у реальному часі. Проведено філогенетичний аналіз ізолятів вірусу африканської чуми свиней на основі послідовностей генів, що кодують білки р54, р72, р30, праймазу та топоізомеразу збудника. Встановлено еволюційну близькість ізолятів вірусу 5-го та 6-го генотипів, 3-го та 19-го, а також 20-го та 21-го генотипів. Визначено потенційні молекулярні маркери для диференціації та ідентифікації вірусу африканської чуми свиней. Показано, що найбільш придатними цільовими мішенями для визначення цього збудника з застосуванням LAMP-технології є гени, що кодують праймазу та топоізомеразу. Розроблено методику для ідентифікації вірусу африканської чуми свиней з застосуванням LAMP-технології. Проведено філогенетичний аналіз ізолятів вірусу хвороби Шмалленберга на основі послідовностей сегментів М, L та S збудника. Підтверджено філогенетичну спорідненість ізолятів вірусу хвороби Шмалленберг за М-сегментом РНК з вірусом Сатупері; за L- та S-сегментами - з вірусом Шамонда. Визначено потенційні молекулярні маркери для детекції вірусу хвороби Шмалленберг. Показано, що найбільш придатною цільовою мішенню для визначення цього збудника з застосуванням стандартного варіанту ПЛР є сегмент S геномної РНК. Розроблено методику для детекції вірусу
Опис продукції
Автори роботи
Ареф'єв Василь Львович
Болотін Віталій Ігоревич
Зленко Оксана Борисівна
Кіт Марина Юріївна
Лиманська Ольга Юріївна
Рудова Наталія Геннадіївна
Солодянкін Олексій Сергійович
Додано/оновлено в НРАТ
2021-01-11
