Пошук академічних текстів

Інформація × Реєстраційний номер 0223U000606, 0122U002425 , Науково-дослідна робота Назва роботи Ідентифікація родини генів тубулінів Brassica rapa та характеристика їх геномної організації у різних підвидів Назва етапу роботи Керівник роботи Пірко Ярослав Васильович, Доктор біологічних наук Дата реєстрації 12-01-2023 Організація виконавець Державна організація "Відділення цільової підготовки Київського національного університету імені Тараса Шевченка при Національній академії наук України" Опис етапу  Під час виконання першого етапу роботи було проведено повну ідентифікацію та характеристику родини генів тубуліна у суріпиці (Brassica rapa). Визначена їх екзон-інтронна структура, встановлено їх приналежність до класів та ізотипів даних білків, уточнено їх філогенетичне положення відносно тубулінів інших видів, а також виконано реконструювання положення даних генів на геномних блоках предкового каріотипу Хрестоцвітих. Поведено аналіз синтенії геномів різних видів, що дозволило виявити тип гомологічних зв’язків ідентифікованих генів та прояснити їх еволюційну історію. Загалом виявлено 9 генів α-тубуліну, серед яких 1 виявився неекспресованим псевдогеном. α-Тубуліни І-го класу мали 4 екзони, а ІІ-го – 5. Виявлено 21 ген β-тубуліну, 5 з яких є псевдогенами III-го класу. Вперше для дводольних рослин виявлено, що у випадку B. rapa консервативність екзон-інтронної структури β-тубуліну порушується – у гена BraA.TUB2.b втрачений перший інтрон. Виявлено лише один ген γ-тубуліну у геномі B. rapa – BraA.TUG1.a., який віднесено до 1-го ізотипу. Ген γ-тубуліну у своїй структурі мав 9 екзонів. Дослідження внутрішньогеномної синтенії підтвердило, що копії генів BraA.TUA2, BraA.TUA5, BraA.TUB4, BraA.TUB7 та BraA.TUB9 виникли в результаті повногеномної триплікації. Ці онологи не були еліміновані у процесі добору, на відміну від генів інших ізотипів тубулінових білків. Для консервативних ізотипів TUA2, TUA5, TUB2 Під час виконання першого етапу роботи було проведено повну ідентифікацію та характеристику родини генів тубуліна у суріпиці (Brassica rapa). Визначена їх екзон-інтронна структура, встановлено їх приналежність до класів та ізотипів даних білків, уточнено їх філогенетичне положення відносно тубулінів інших видів, а також виконано реконструювання положення даних генів на геномних блоках предкового каріотипу Хрестоцвітих. Поведено аналіз синтенії геномів різних видів, що дозволило виявити тип гомологічних зв’язків ідентифікованих генів та прояснити їх еволюційну історію. Опис продукції Автори роботи Афанасьєва Катерина Сергіївна Блюм Ростилав Ярославович Пірко Ярослав Васильович Рябоконь Анастасія Миколайовна Сахарова Владіслава Генадіївна Свиридова Катерина Олексійовна Чопей Мар'яна Ігорівна Додано в НРАТ 2023-01-12 Закрити