Пошук академічних текстів

Інформація × Реєстраційний номер 0226U001547, (0125U002944) , Науково-дослідна робота Назва роботи Геномна еволюція родини генів тубуліну у різних підвидів Brassica rapa Назва етапу роботи Геномна ідентифікація родини генів тубулінів у різних підвидів суріпиці (Brassica rapa) Керівник роботи Блюм Ростислав Ярославович, Дата реєстрації 27-01-2026 Організація виконавець Державна установа "Інститут харчової біотехнології та геноміки Національної академії наук України" Опис роботи Метою запропонованої науково-дослідної роботи є вивчення геномної еволюції родини генів тубуліну у різних підвидів суріпиці (Brassica rapa) шляхом проведення комплексного біоінформатичного аналізу та молекулярно-генетичного аналізу. Робота передбачає ідентифікацію, структурну анотацію та порівняння послідовностей генів тубуліну у представників різних підвидів суріпиці, із залученням передових підходів порівняльної геноміки та великого обсягу геномних даних (до 30 збірок геномів підвидів B. rapa). Окремим завданням є оцінка варіабельності інтронів β-тубулінових генів для виявлення надійних маркерів поліморфізму довжини інтронів (Intron Length Polymorphism, ILP), що дозволить створити інформативну систему молекулярних маркерів для використання у селекційній роботі. У ширшому контексті, проєкт дозволить відстежити еволюцію родини генів тубуліну в межах виду B. rapa та отримати нові знання про функціональну роль цих генів у формуванні міжпідвидової генетичної диференціації. Отримані результати матимуть практичну цінність для біології розвитку рослин, геноміки, систематики та селекції хрестоцвітих культур. Опис етапу Під час виконання 1-го етапу роботи здійснено повногеномну ідентифікацію генів родини тубулінів у різних підвидів B. rapa (на основі 8 доступних збірок геномів). Проведений аналіз включав дослідження структурної організації генів (екзон-інтронна будова, хромосомна локалізація), а також встановлення їх ортологічних співвідношень і еволюційних зв’язків, спираючись на дані серії філогенетичних аналізів та повногеномних порівнянь. Також, було виявлено, що гени деяких ізотипів тубуліну характеризуються підвищеним рівнем інтронної варіації, зумовленим у тому числі наявністю мікросателітних послідовностей. Спираючись на отриману інформацію щодо варіабельності інтронних послідовностей генів β-тубуліну, нами було здійснено оцінку поліморфізму довжини 1-го (TBP) та 2-го (сTBP) інтронів β-тубуліну. За допомогою комбінованого TBP/сTBP-аналізу нам вдалося не лише диференціювати різні таксономічні групи сортів B. rapa, а також прослідкувати походження окремих селекційних форм гібридної суріпиці. Опис продукції Автори роботи Блюм Ростислав Ярославович Сахарова Владислава Геннадіївна Додано в НРАТ 2026-01-27 Закрити