Пошук академічних текстів

Інформація × Реєстраційний номер 0415U003317, Кандидатська дисертація На здобуття к.б.н. Дата захисту 28-04-2015 Статус Запланована Назва роботи Характеристика CHI3L1, молекулярного маркера гліобластом, та типування гліобластом за профілем експресії генів Здобувач Єршов Антон Вікторович, Керівник Дмитренко Володимир Володимирович Опонент Матишевська Ольга Павлівна Опонент Солдаткіна Марія Олександрівна Опис Дисертація присвячена характеристиці механізмів регуляції експресії гена CHI3L1, надекспресованого в гліобластомах, і визначенню особливостей його функціонування, а також типуванню гліобластом за профілем експресії генів. В ході роботи встановлено, що у хворих з первинними гліобластомами, G/G-гомозиготних за однонуклеотидним поліморфізмом -131C->G в промоторі CHI3L1, наявна тенденція до зменшення експресії CHI3L1. Було досліджено вплив транскрипційного фактору p53 на продукцію CHI3L1 і показано, що експресія CHI3L1 в клітинах лінії U87, що походять з гліобластоми, може бути знижена за рахунок надекспресії TP53, активації протеїна p53 або через блокування його деградації. Встановлено, що інгібування деацетилази гістонів SIRT1 знижує експресію CHI3L1 в клітинах U87. Порівнянням структур двох гомологічних протеїнів, що мають протилежний вплив на проліферацію клітин: просторової моделі CHI3L2, отриманої моделюванням за гомологією, зі структурою CHI3L1 показано, що CHI3L1 має дві відмінні функціональні одиниці - реорганізований ліганд-зв'язуючий сайт і поверхневий позитивно заряджений гепарин-зв'язуючий мотив. За допомогою сайт-спрямованого мутагенезу встановлено, що протеїн CHI3L1 зв'язується з гепарином через кластер позитивно заряджених амінокислот на поверхні протеїна, і цей гепарин-зв'язуючий сайт може бути відповідальним за субстрат-незалежний ріст клітин 293 з надпродукцією CHI3L1. Розроблено підхід субтипування гліобластом, який полягає в об'єднанні даних генної експресії з різних робіт, визначенні числа груп в масиві даних, проведенні кластерного аналізу та перевірці результатів за допомогою незалежного методу - нейромережевого аналізу. За профілем експресії обраних в даній роботі 416 генів визначено два підтипи гліобластом, "проліферативний" та "пронейральний", які можуть відображати особливості їхнього розвитку. Типування гліобластом за профілем експресії генів в подальшому може допомогти розробити стратегії їхнього лікування. Дата реєстрації 2015-04-28 Додано в НРАТ 2020-04-03 Закрити