Реєстраційний номер
0217U006292,
0116U000238
, Науково-дослідна робота
Назва роботи
Встановити видо- та родоспецифічні генетичні маркери збудників основних вірусних інфекцій хвороб хутрових звірів та м'ясоїдних (вірус міксоми, каліцивірус, парвовірус, параміксовірус, аденовірус, коронавірус) на основі молекулярно-генетичних технологій
Назва етапу роботи
Керівник роботи
Герілович Антон Павлович,
Дата реєстрації
15-03-2017
Організація виконавець
Національний науковий центр "Інститут експериментальної і клінічної ветеринарної медицини"
Опис етапу
Сформовано базу даних секвенованих послідовностей геномного матеріалу, основних генів та їх фрагментів нових (починаючи з 2012 р.) ізолятів збудників парвовірусного ентериту собак, панлейкопенії котів, Алеутської хвороби норок. Проведено пошук у базах даних GenBank, EMBL, DDBJ послідовностей генів парвовірусів м'ясоїдних. Встановлено, що у базах даних міститься інформація щодо близько 200 частково або повністю секвенованих послідовностей генів та геномних ДНК вірусу панлейкопенії кішок (Feline panleukopenia virus, FPV), 600 - парвовірусу собак (Canine parvovirus, CPV), близько 2700 послідовностей - вірусу Алеутської хвороби норок (Aleutian mink disease parvovirus, AMDPV). Створено бази даних: 1) FPV - повністю секвеновані послідовності генів VP1 та VP2, що кодують структурні білки, довжиною близько 2100 пар нуклеотидів (п.н.) та 1600 п.н. відповідно; геномних ДНК довжиною близько 4600 п.н. (усього 67 послідовностей); 2) CPV - повністю секвеновані послідовності генів VP2 та NS-1, що кодують неструктурні білки, довжиною близько 1900 та 2000 п.н. відповідно; геномних ДНК довжиною близько 4500 п.н. (усього 118 послідовностей); 3) AMDPV - повністю секвеновані послідовності генів VP1, VP2, NS-1 довжиною близько 2200 п.н., 1700 п.н. та 2000 п.н. відповідно; геномних ДНК довжиною близько 5000 п.н. (усього 183 послідовності). Усі послідовності отримано у форматах FASTA (*.fasta) або GenBank (*.gb), що дозволить застосовувати сучасне молекулярно-біологічне програмне забезпечення (в тому числі у режимі on-line) для проведення парного та множинного, локального та глобального вирівнювання для визначення консервативних і варіабельних фрагментів генів. Створені праймерні системи на основі консервативних генів протеїнів для індикації та ідентифікації збудників парвовірусних інфекцій м'ясоїдних.
Опис продукції
Праймерна система дозволяє одночасно виявляти геномну ДНК усіх парвовірусів м'ясоїдних (парвовірусного ентериту собак, алеутської хвороби норок, панлейкопенії кішок) у клінічному матеріалі, проводити швидку та надійну індикацію, що повністю задовольняє діагностичні потреби. Чутливість та специфічність праймерної системи знаходяться в межах, визначених та рекомендованих МЕБ.
Автори роботи
Келеберда Микола Іванович
Кузнецов Євген Петрович
Рудова Наталія Генадіївна
Солодянкін Олексій Сергійович
Фісенко Світлана Анатоліївна
Додано/оновлено в НРАТ
2020-04-02
