Реєстраційний номер
0218U002532,
0117U002792
, Науково-дослідна робота
Назва роботи
Використання Грід та напрацювань віртуальної організації CSLabGrid для високопропускного скринінгу інгібіторів тубуліну фітопатогенних грибів
Назва етапу роботи
Керівник роботи
Блюм Ярослав Борисович,
Дата реєстрації
05-04-2018
Організація виконавець
Державна установа "Інститут харчової біотехнології та геноміки НАН України"
Опис етапу
Здійснена реконструкція просторової структури 82-х альфа-тубулінів, 111-ти бета-тубулінів і 47-ми гама-тубулінів, що належали представникам 62-х видів фітопатогенних грибів. Усі моделі пройшли етап короткочасної молекулярної динаміки (1 нс) в програмі Gromacs (IFBG Cluster) і були депоновані до штатної бази даних ВО CSLabGrid - CSModDB.
Опис продукції
За результатами молекулярного докінгу сполук-лідерів у ГТФ/ГДФ-обмінний сайт тубуліну найбільша спорідненість ліганду і мішені спостерігалась у випадку сполук F0478-0265, B0367 і a-тубуліну, а також сполук B0066, F0478-0271 і B0114 і b-тубуліну із Puccinia triticina. За результатами молекулярного докінгу сполук-лідерів у таксол-зв'язуючий сайт b-тубуліну найбільша спорідненість ліганду до мішені спостерігалась у випадку сполук F0478-0219, F0478-0166 і b-тубуліну Puccinia graminis f. sp. Tritici (А:), а також сполуки F0478-0385 і b-тубуліну Magnaporthe oryzae.
Автори роботи
Демчук О.М.
Карпов П.А.
Ожерєдов С.П.
Раєвський О.В.
Співак С.І.
Додано/оновлено в НРАТ
2020-04-02
