Пошук академічних текстів

Керівник: Горб Леонід Григорович. Динамічна структура нуклеїнових кислот і механізми їх взаємодії з біологічно активними речовинами. (Етап: За допомогою статичних та динамічних методів квантової хімії вивчити електронно-топологічні причини різної стабілізації А- і В-форм міні-спіралей ДНК - d(A)5∙d(T)5 і d(G)5∙d(C)5 під впливом навколишнього середовища За допомогою високопродуктивного віртуального скринінгу на моделях 1117 білків-мішеней дослідити поліфармакологічні властивості похідних кверцетину, інших гідроксіфлавонів і акридонів Провести широкомасштабне дослідження вторинної структури домену, що замикається дуплексом U5-AUG у геномах ВІЛ-1 різних димеризаційних груп.). Інститут молекулярної біології і генетики Національної академії наук України. № 0226U004545

Керівник: Горб Леонід Григорович. Динамічна структура нуклеїнових кислот і механізми їх взаємодії з біологічно активними речовинами. (Етап: Вивчити in silico особливості переносу протону від тиміну до аденіну у міні-спіралі, яка має будову dА5∙dТ5 Дослідити in silico та in vivo взаємодію кварцетину, лютеолину, апигеніну та їх алкілованих похідних з вірусними мішенями, такими як: helicase, pappiloma virus, helicase HCV, PB2 influenza та нейрамінідаза вірусу грипу. Виявити закономірності структура-функція. Вивчити in silico первинну та вторинну структури сайту геномної РНК ВІЛ-1, яка регулює процес стабілізації мРНК.). Інститут молекулярної біології і генетики Національної академії наук України. № 0226U004543

Керівник: Горб Леонід Григорович. Динамічна структура нуклеїнових кислот і механізми їх взаємодії з біологічно активними речовинами. (Етап: Пошук повної множини конформаційно-таутомерних перетворень пари А•Т. Виокремлення з-поміж них маршрутів, відповідальних за виникнення спонтанних точкових помилок реплікації). Інститут молекулярної біології і генетики Національної академії наук України. № 0226U004541

Керівник: Горб Леонід Григорович. Динамічна структура нуклеїнових кислот і механізми їх взаємодії з біологічно активними речовинами. Інститут молекулярної біології і генетики Національної академії наук України. № 0126U004259

Керівник: Дубей Ігор Ярославович. Нові підходи до мішень-спрямованого пошуку потенційних протипухлинних та протиінфекційних засобів для подолання проблеми резистентності до ліків. (Етап: Визначення особливостей взаємодії інгібіторів АРСаз із ензимами з використанням докінгу, молекулярної динаміки та метадинаміки. Біохімічне тестування інгібіторів АРСаз, ТопоІ та FGFR1 in vitro, структурна оптимізація інгібіторів на основі моделей зв'язування, критеріїв подібності до лікарських засобів та даних біологічного тестування. Дослідження антипроліферативної дії активних інгібіторів FGFR1 на пухлинних клітинних лініях. Оцінка цитотоксичності інгібіторів ТопоІ та FGFR1. Дослідження структури області, що містить 3'-сайт сплайсингу А7 і елементи, що регулюють його функціонування, в геномних РНК ВІЛ-1 різних груп і підтипів і геномних РНК вірусу ВІМ та створення відповідних розділів бази даних. Узагальнення результатів досліджень.). Інститут молекулярної біології і генетики Національної академії наук України. № 0225U004063

Керівник: Дубей Ігор Ярославович. Нові підходи до мішень-спрямованого пошуку потенційних протипухлинних та протиінфекційних засобів для подолання проблеми резистентності до ліків. (Етап: Побудова фармакофорних моделей МетРС та ЛейРС M.tuberculosis, фармакофорний скринінг і відбір лігандів, тестування їхньої інгібувальної активності in vitro на рекомбінантних ензимах. Аналіз залежності "структура-активність" інгібіторів ТопоІ та FGFR1. Розробка моделі зв'язування інгібіторів з активним сайтом FGFR1. Структурна оптимізація знайдених у процесі скринінгу інгібіторів ТопоІ та FGFR1. Вивчення інгібувальної дії нових сполук щодо еукаріотичної та бактеріальної ТопоІ. Дослідження взаємодії інгібіторів з ДНК й топоізомеразним біофізичними методами. Оцінка протимікробної дії інгібіторів у бактеріальних культурах. Дослідження структури області, яка контролює програмований зсув рамки зчитування при трансляції гену gag, в геномних РНК ВІЛ-1 різних груп і підтипів і геномних РНК вірусу ВІМ та створення відповідних розділів бази даних.). Інститут молекулярної біології і генетики Національної академії наук України. № 0225U004059

Керівник: Горб Леонід Григорович. Аналіз регуляторних елементів геномних РНК і ДНК патогенних вірусів людини методами комп'ютерної біології. Інститут молекулярної біології і генетики Національної академії наук України. № 0125U002675