Пошук академічних текстів

Керівник: Дубей Ігор Ярославович. Нові підходи до мішень-спрямованого пошуку потенційних протипухлинних та протиінфекційних засобів для подолання проблеми резистентності до ліків. (Етап: Визначення особливостей взаємодії інгібіторів АРСаз із ензимами з використанням докінгу, молекулярної динаміки та метадинаміки. Біохімічне тестування інгібіторів АРСаз, ТопоІ та FGFR1 in vitro, структурна оптимізація інгібіторів на основі моделей зв'язування, критеріїв подібності до лікарських засобів та даних біологічного тестування. Дослідження антипроліферативної дії активних інгібіторів FGFR1 на пухлинних клітинних лініях. Оцінка цитотоксичності інгібіторів ТопоІ та FGFR1. Дослідження структури області, що містить 3'-сайт сплайсингу А7 і елементи, що регулюють його функціонування, в геномних РНК ВІЛ-1 різних груп і підтипів і геномних РНК вірусу ВІМ та створення відповідних розділів бази даних. Узагальнення результатів досліджень.). Інститут молекулярної біології і генетики Національної академії наук України. № 0225U004063

Керівник: Дубей Ігор Ярославович. Нові підходи до мішень-спрямованого пошуку потенційних протипухлинних та протиінфекційних засобів для подолання проблеми резистентності до ліків. (Етап: Побудова фармакофорних моделей МетРС та ЛейРС M.tuberculosis, фармакофорний скринінг і відбір лігандів, тестування їхньої інгібувальної активності in vitro на рекомбінантних ензимах. Аналіз залежності "структура-активність" інгібіторів ТопоІ та FGFR1. Розробка моделі зв'язування інгібіторів з активним сайтом FGFR1. Структурна оптимізація знайдених у процесі скринінгу інгібіторів ТопоІ та FGFR1. Вивчення інгібувальної дії нових сполук щодо еукаріотичної та бактеріальної ТопоІ. Дослідження взаємодії інгібіторів з ДНК й топоізомеразним біофізичними методами. Оцінка протимікробної дії інгібіторів у бактеріальних культурах. Дослідження структури області, яка контролює програмований зсув рамки зчитування при трансляції гену gag, в геномних РНК ВІЛ-1 різних груп і підтипів і геномних РНК вірусу ВІМ та створення відповідних розділів бази даних.). Інститут молекулярної біології і генетики Національної академії наук України. № 0225U004059

Керівник: Дубей Ігор Ярославович. Нові підходи до мішень-спрямованого пошуку потенційних протипухлинних та протиінфекційних засобів для подолання проблеми резистентності до ліків. (Етап: Експресія й очищення ЛейРС і МетРС M. tuberculosis. Докінг колекції сполук у сайти зв'язування обраних мішеней, відбір перспективних сполук та тестування їхньої інгібувальної активності на рекомбінантних ензимах in vitro. Синтез та дослідження інгібіторів ТопоІ в системі релаксації ДНК in vitro. Аналіз антипроліферативної дії інгібіторів ТопоІ у культурах пухлинних клітин. Моделювання взаємодії інгібіторів з ДНК-топоізомеразним комплексом квантово-хімічними методами Біохімічне тестування інгібіторів FGFR1 in vitro. Дослідження залежності активності інгібіторів від структури та розробка моделі зв'язування інгібіторів з активним сайтом FGFR1. Дослідження різних моделей структури, що охоплює субдомен PBS і шпильки DIS, SD і Psi, в геномних РНК ВІЛ-1 різних груп і підтипів і геномних РНК вірусу ВІМ та створення відповідних розділів бази даних.). Інститут молекулярної біології і генетики Національної академії наук України. № 0225U004052

Керівник: Дубей Ігор Ярославович. Нові підходи до мішень-спрямованого пошуку потенційних протипухлинних та протиінфекційних засобів для подолання проблеми резистентності до ліків. (Етап: Побудова моделей МетРС і ЛейРС людини. Порівняння сайтів зв'язування ензимів M. tuberculosis і людини для пошуку відмінностей, важливих для розробки інгібіторів, селективних до патогенів. Створення генноінженерних конструкцій для одержання рекомбінантних МетРС і ЛейРС людини. Дослідження інгібувальної дії сполук щодо еукаріотичної та бактеріальної ТопоІ в системі релаксації ДНК in vitro. Отримання рекомбінантного аналога FGFR1 людини. Проведення біохімічного тестування активності інгібіторів FGFR1 in vitro Дослідження різних схем експонування сигналу PAS в домені PBS геномних РНК ВІЛ-1 різних груп і підтипів і геномних РНК вірусу ВІМ, створення відповідних розділів бази даних.). Інститут молекулярної біології і генетики Національної академії наук України. № 0225U004040

Керівник: Дубей Ігор Ярославович. Нові підходи до мішень-спрямованого пошуку потенційних протипухлинних та протиінфекційних засобів для подолання проблеми резистентності до ліків. (Етап: Побудова гомологічних моделей МетРС і ЛейРС M.tuberculosis, дослідження сайтів зв'язування аміноацил-аденілатів. Створення генноінженерної конструкції для одержання рекомбінантних МетРС і ЛейРС M.tuberculosis. Дизайн структур потенційних інгібіторів ТопоІ, розробка методів отримання та синтез сполук. Оптимізація методики комп'ютерного пошуку інгібіторів FGFR1 та проведення рецепторно-орієнтованого віртуального скринінгу сполук з метою відбору сполук для тестування in vitro. Вдосконалення й розширення функціональності програмного забезпечення бази даних CESSHIV-1.). Інститут молекулярної біології і генетики Національної академії наук України. № 0225U004034

Керівник: Тукало Михайло Арсентійович. Молекулярні механізми контролю якості трансляції за участю непротеїнових амінокислот. (Етап: Вивчення можливої токсичності D-аланіну на різних клітинних лініях людини. Вивчення методом сайт-спрямованого мутагенезу елементів АлаРС і тРНКАла T. thermophilus, які є найбільш важливими для аміноацилування та корекції помилок.). Інститут молекулярної біології і генетики Національної академії наук України. № 0225U001635

Керівник: Тукало Михайло Арсентійович. Молекулярні механізми контролю якості трансляції за участю непротеїнових амінокислот. (Етап: Вивчення помилкового включення норваліну, норлейцину та гомоцистеїну на місце лейцину в білки клітинних ліній людини у середовищі з підвищеною концентрацією відповідних амінокислот.). Інститут молекулярної біології і генетики Національної академії наук України. № 0225U001366

Керівник: Тукало Михайло Арсентійович. Молекулярні механізми контролю якості трансляції за участю непротеїнових амінокислот. (Етап: Вивчення механізму пост-трасферного редагування ЛейРС людини методами мутагенезу, швидкої кінетики та обчислювальними методами. Вивчення експресії гена ЛейРС в тканинах раку нирок та раку молочної залози.). Інститут молекулярної біології і генетики Національної академії наук України. № 0225U001182

Керівник: Тукало Михайло Арсентійович. Молекулярні механізми контролю якості трансляції за участю непротеїнових амінокислот. (Етап: Клонування і експресія в E.coli аланіл-тРНК синтетаз Enterococcus faecalis і людини та вивчення їх редагувальної активності відносно D-аланіну.). Інститут молекулярної біології і генетики Національної академії наук України. № 0225U001090

Керівник: Тукало Михайло Арсентійович. Комбіновані тест-системи для діагностики та аналізу експресії генів вродженого імунітету при особливо небезпечних вірусних інфекціях. (Етап: ). Інститут молекулярної біології і генетики Національної академії наук України. № 0221U106739